陆地棉PP2C家族基因发掘及表达分析开题报告

 2022-02-07 20:43:17

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

课题的研究意义

磷酸化与去磷酸化是一种重要的蛋白质修饰方式,其可调节细胞内多种蛋白质的生物活性,进而快速影响细胞代谢,影响细胞信号调控级联反应和基因转录活性。蛋白磷酸化与去磷酸化是通过蛋白激酶和蛋白磷酸酶调控的。2c型磷酸酶(protein phosphatase 2c,pp2c)是一种重要的蛋白磷酸酶,可以特异性地脱去磷酸化的丝/苏氨酸残基上的磷酸基团,其在脱落酸信号转导途径中起着重要的调控作用。脱落酸常被称为胁迫激素,在植物遭遇诸如干旱、冷冻、热激、盐胁迫等非生物逆境时发挥着重要作用。对pp2c的深入研究可以帮助人们了解植物应答胁迫的方式,为作物的遗传改良提供理论基础。

陆地棉是一种重要的四倍体棉花品种,是重要的纺织原料和油料作物,是我国重要的经济作物,对陆地棉中pp2c家族基因的发掘和表达分析可为陆地棉的遗传改良提供重要的理论依据。

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2. 研究的基本内容和问题

本课题研究的目标及内容为对陆地棉PP2C基因家族进行全基因组的分析,并利用荧光定量PCR技术测定相关基因在不同胁迫条件的相对表达量,进一步阐明PP2C的功能及对胁迫的响应方式。拟解决陆地棉中PP2C基因家族进化关系不明晰、应答胁迫方式不明确等问题。

3. 研究的方法与方案

研究方法

1. 利用tair网站调取目的基因

tair是国际上最为权威的拟南芥基因组数据库和拟南芥基因组注释系统,具有丰富的数据资源和最新的注释信息。

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4. 研究创新点

棉花全基因组数据的发布,使我们能够基于生物信息学工具对棉花PP2C基因家族进行全面的描述,并对相关基因进行了表达量分析。本课题的创新之处在于这是首次全面展开对棉花品种中PP2C基因家族的鉴定和表达谱分析。

5. 研究计划与进展

2018.10-2019.1

进行相关植物材料的种植及处理,进行植物材料rna的提取及反转录,获得各处理条件下植物材料的cdna

2019.2-2019.4

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