拟南芥中AtNDX参与调控DNA去甲基化过程的研究开题报告

 2022-02-08 20:10:43

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

dna甲基化(dna methylation)是表观遗传修饰调控途径之一,在已知的真核细胞中均有发现,它是指借助甲基转移酶,在dna胞嘧啶碱基c的5号碳原子上连接甲基基团,形成5-甲基胞嘧啶(5-mc)这一过程[1] ,甲基基团来自于s-腺苷甲硫氨酸(sam)。

dna甲基化对于动植物正常、健康的生长发育十分重要,因此dna甲基化的建立与维持是我们所需要探究的内容之一,动物胚胎死亡的原因之一即为dna甲基化缺陷,它也会使植物的生长形态出现异常[2],对于植物而言,研究dna甲基化对于我们了解如何保持基因组的稳定性和推进植物健康、正常的生长具有关键作用。

有研究表明,atndx是一种含有同源结构域的蛋白质,具有维持r环稳定性的作用[3] ,而r环抑制coolair转录, 它的差异化稳定可能是影响许多生物体中基因表达的一般机制,atndx同源结构域r环稳定化是调节lncrna coolair表达的重要因子[4]。

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2. 研究的基本内容和问题

表观遗传修饰的一项重要调控方式即为dna甲基化,它对于生物体调控基因表达、控制遗传发育、确保基因组稳定性和对胁迫刺激等产生反应都有着关键性作用。

ros1在拟南芥主动去甲基化过程中起非常重要的作用,其基因突变后会引起拟南芥基因组部分位点甲基化的升高。

拟南芥中关于dna主动去甲基化的分子机制探索尚不完善。

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3. 研究的方法与方案

验中涉及的研究方法如下:幼苗培养 用0.5%naclo溶液对种子消毒15min,用灭菌水清洗种子6次后播种于相应培养基上,用微孔通气型医用胶带封口后放于4℃冰箱中同步化处理。

c24背景植物同步化4天,col背景植物同步化3天,之后放入光照培养箱中培养,培养条件为22小时光照/2小时黑暗、恒温22℃、50μmm-2s-1光照强度和70-80%的相对湿度。

温室培养 将营养土、黄土和蛭石按的1:1:1比例混合均句后装入培养盆中,浇水,将在培养皿中生长7-10天的幼苗以9株/盆移入土中,于18-22℃、16小时光照/8小时黑暗和100μmm-2s-1光照强度的温室中进行培养。

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4. 研究创新点

人们已发现dna去甲基化在拟南芥及其他植物中发挥着重要生物学功能,但这些物种中dna去甲基化的途径及负责关键反应的酶还都未知。

而本课题以拟南芥作为研究材料,因其基因组小、生活周期短、便于遗传筛选。

经过研究,我们所了解到的有关拟南芥中dna去甲基化的知识将可以作为未来研究一些重要作物中dna去甲基化机制的基础。

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5. 研究计划与进展

2017年12月下旬完成文献综述,并明确选题,对于课题进行初步的了解。

2018年3月上旬完成开题报告,并明确具体的研究实施方案,形成毕业设计的基本框架。

2018年4月上旬对课题完成情况进行自查,做出一定的反思和完善。

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