1. 研究目的与意义
本文综述了目前植物中的SSR及SSR挖掘的国内外研究进展，以期为从油茶454深度测序获得的大量DNA序列、EST序列中挖掘SSR信息并进行比对分析奠定理论及技术基础。
2. 国内外研究现状分析
从2009年至今，已有多个物种应用454测序技术开发了微卫星标记。
EST-SSR的开发已在农作物中广泛应用，在水稻[19]、甘蔗、大麦、葡萄、苜蓿和小麦中已有报道；而对于木本植物，在银杏[10]、桃、猕猴桃、云杉、火炬松、柑橘、柽柳[6] 、咖啡树、桉树、茶树[5]、杨树、枳壳[8]、白桦、鹅掌楸和橡胶树[9]等物种中也已有报道。
3. 研究的基本内容与计划
本研究期望通过分析山茶属物种的微卫星分布特点，包括微卫星各种重复基元所占百分比含量；微卫星重复基元的长度、丰度变异情况；微卫星的出现跨度和频率；微卫星在EST编码区域及非编码区域的分布规律，了解山茶属典型物种的微卫星分布特征,并初步论证各油茶物种SSR标记的通用性.
4. 研究创新点
为有效开发和利用SSR标记奠定材料基础。
为油茶SSR标记开发的进一步研究奠定技术基础。
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