玉米SBP家族基因功能预测及其生物信息学分析任务书

 2023-10-12 09:00:39

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

为了更好地了解玉米SBP家族基因的生物学功能,采用生物信息学方法对玉米SBP家族基因家族进行一系列分析。本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的转录因子与玉米基因组数据对比,并设置一些严格的筛选标准,从玉米SBP基因组中挖掘一些SBP转录因子,系统发育分析显示,单子叶植物玉米和水稻的SBP基因保守性更强、亲缘关系更近。通过基因分析注释以及启动子功能预测,进一步发现SBP家族基因参与植物生长发育,形态建成、逆境胁迫响应等过程。

2. 实验内容和要求

内容主要分为以下几个内容:

(1)玉米sbp转录因子的鉴定

(2)玉米sbp转录因子的系统发育关系

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3. 参考文献

[1] friechman j i, heard j, martin g, et al. arabiddopsis transeription factors: genome-wide comparative analysis among eukaryotes[j]. science, 2000,290(5499): 2105-2110

[2] guo a y, zhu q h,gu x, et al.genome-wide identification and evolutionary analysis of the plant specific sbp-box transcription factor family[j]. gene. 2008, 418(1-2): 1-8.

[3] klein j, saedler h, huijser p. a new family of dna binding proteins includes putative transcriptional regulators of the antirrhinum majus floral meristem identity gene squamosa[j]. mol gen genel, 1996,250(1):7-16

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4. 毕业设计(论文)计划

(1)明确论文任务、搜集资料:2022.2.21-2022.3.28

(2)搜集资料确定论文大纲:2022.4.1-2022.4.9

(3)撰写论文初稿:2022.4.12-2022.4.20

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