1. 研究目的与意义
研究目的：随着网络和图像处理技术的提高，技术不仅改变了生活，同时也改变了生物学研究的数据处理方式。
在线ssr分析系统旨在为生物学研究者们提供在线处理ssr数据的全面帮助。
通过这款软件的开发和应用，可以迅速对ssr的丰度、重复基元分布、重复方式分布、重复次数分布等数据进行精准统计，并且进行图像化处理，有效地节省研究者们处理、分析ssr数据的时间。
2. 国内外研究现状分析
国内研究状况：目前，国产的ssr分析软件特别的缺乏，缘由起步较晚，发展不均衡，现有如张富民编写的 amova，通过dcfa1.1生成amova分析所需的文件。
最为突出的特点是分子方差分析法(analysis of molecular variance)通过估计单倍型(含等位基因) 或基因型之间的进化距离,进行遗传变异的等级剖分,引入进化距离(evolutionary distance) 来计量并计算单倍型(或基因型) 间的方差 ,使所有种类的单倍型之间的差方组成一个距离矩阵，是研究种群遗传结构必不可少的一环。
国外研究状况：国外的ssr分析研究处于相对完善的阶段，自20世纪80年代对于使用ssr作为探针用于人的指纹分析应用的首次成功，ssr迅速发展成为新的遗传分子标记系统，但直到21世纪众多的ssr分析软件才如雨后春笋般冒出，且功能全面、深层，如fstat用于检验种群的遗传多样性参数；arlequin可比较来源种群和入侵种群的遗传多样性变化，分析种群间分化程度及变异来源的； popgene：被用于ssr多态性评价等等。
3. 研究的基本内容与计划
研究内容：前期准备：通过基因库获取叶绿体基因组，并利用misa提取叶绿体微卫星。
之后主要通过可缩放矢量图形在线显示cpssr的丰度，重复基元分布，重复方式分布，重复次数分布。
研究计划：2019.2.25~2019.3.16：完成开题报告及相对应的文献综述；2019.3.18~2019.3.25：完成设计开发计划及技术方案；2019.3.26~2019.4.22：完成项目开发源代码及代码文档2019.4.23~2019.5.18：完成毕业设计论文
4. 研究创新点
1. 在线显示形式代替以往常规的窗口形式2. 依托网站，免去下载安装的烦恼3. 大大减少传统人工方式所耗费的时间4. 多角度、全面分析数据
