理论研究取代基对N-H…O=C氢键二聚体中氢键强度的影响开题报告

 2021-08-08 19:52:18

1. 研究目的与意义

氢键是一种重要的分子内或分子间的相互作用。通常可以表示为X-H...Y的形式。氢键在许多的化学和生物过程中起到很重要的作用。例如稳定生物分子的结构,调节酶反应的速度和特性,构造超分子等。因此对其本质进行深入的研究具有重要的意义。

2. 国内外研究现状分析

Dixon等使用了MP2/aug-cc-pVDZ、MP2/aug-cc-pVTZ、MP2/aug-cc-pVQZ方法对甲酰胺二聚体和N-甲基乙酰胺二聚体体系中N-HO=C和C-HO=C氢键进行了研究。研究得出了甲酰胺二聚体中N-HO=C的平均键能能量为-7.1kcal/mol,而N-甲基乙酰胺二聚体中N-HO=C的平均氢键能量为-8.6kcal/mol。Dannenberg 与他的同事对包含有链状的脲和甲酰胺分子的线性氢键体系进行了广泛的研究,通过HF、DF和MP2方法计算。Wang等使用了B3LYP和MP2方法对蛋白质分子中反平行的、平行的β折叠结构的结合能进行了理论研究。研究表明B3LYP方法计算得到的结合能比MP2方法计算得到的结合能小。Li等使用了MP2/aug-cc-pVDZ、MP2/aug-cc-pVTZ方法研究了甲基对C-HO氢键强度的调节作用。确定了部分碱基对中单个氢键强度。Tan等使用了B3LYP方法和cc-pVTZ基组对自己设计的两个分子体系进行了氢键协同作用的研究。得出了这些体系中存在的氢键协同作用是由于c-NMF分子中电荷转移引起的。Mohajeri等使用了B3LYP方法对15个核算碱基对这N-HN和N-HO氢键强度进行了研究

3. 研究的基本内容与计划

本课题拟采用密度泛函DFT方法和MP2方法,采用多种尺度基组,优化甲酰胺及其衍生物的几何结构,分析其电子结构,讨论氢键成键本质,计算BSSE校正后的氢键能,并探讨取代基对氢键能及成键本质的影响。

4. 研究创新点

1.理论计算甲酰胺二聚体的几何结构和电子结构。

2.理论计算不同取代基取代后的甲酰胺二聚体的几何结构和电子结构,从而分析出取代基对氢键强度的影响规律。

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