1. 研究目的与意义
研究目的：基于鹅掌楸转录组的数据开发ssr引物，探索多态性较好ssr的结构特性,开发更多的ssr引物,有助于鹅掌楸的研究。
研究意义：转录组ssr的特点决定了其来自表达基因，可能与基因功能表达有直接和间接的关系。
利用转录组数据开发ssr分子标记相较于传统基因组ssr可能效率更高，且与常规数据配合分析，更易找到与性状相关的分子标记。
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2. 国内外研究现状分析
chen等发明属于生物技术领域，涉及一种基于转录组测序开发菊属植物ssr引物的方法。
应用本方法成功地设计了1788对ssr引物，为菊属ssr引物开发进而实现分子标记辅助选择育种和比较基因组学研究提供了新的方法和思路。
yuan 等利用软件misa对水生植物莕菜转录组测序所获得的79536条est序列进行分析，共检测出12319个est-ssr位点。
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3. 研究的基本内容与计划
研究内容：以杂交鹅掌楸为实验材料，结合高通量测序获得的海量转录组数据，分析数据，找寻ssr位点。
严格按照引物设计的规范、要求。
结合材料实际，开发出一批高质量的引物，并对引物适用性进行验证。
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4. 研究创新点
从EST数据库中获得SSR建立EST - SSR标记更经济，效率更高。
最关键的是，EST - SSR标记来源于DNA的转录区域，相比基因组SSR标记，EST - SSR种间通用性更高
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