基于环介导等温扩增技术检测樟疫霉开题报告

 2021-08-08 23:47:30

1. 研究目的与意义

一、研究的目的及意义

樟疫霉属于卵菌门(Oomycota)、卵菌纲(Oomycetes)、霜霉目(Peronosporales)、腐霉科(Pythiaceae)、疫霉属( Phytophthora)。樟疫霉(Phytophthora cinnamomi)可以引起樟属植物产生疫霉病害,造成极大损失。樟疫霉(Phytophthora cinnamomi)可侵染樟属植物引起根部腐烂以及枝干溃疡等病害,会对樟属植物造成毁灭性打击。据报道,樟疫霉已经造成澳大利亚西南地区森林发生结构和植物种群变化,已经严重威胁到当地自然生态系统以及生物多样。本研究采用生物信息学和比较基因组学方法,筛选樟疫霉病菌的核心基因作为分子检测靶标;研发了樟疫霉病菌的DNA 环介导的恒温扩增检测技术,并对技术进行评价并优化,最终建立了针对樟疫霉准确、快速、灵敏的检测技术体系。

2. 国内外研究现状分析

二、国内外同类研究概况

我国樟科植物众多,国外有关樟疫霉对樟科植物造成严重危害的报道较多,而国内对其研究较少。

土传樟疫霉被认为与板栗(栗水稻)的大多数病原菌种类发生在欧洲。其发病率和分布的映射从育苗造林的土壤可以限制传播提供有价值的信息。作为传统的生物分析和分类确认通常是费时费力的,我们集中在一个特定的着陆发展多重巢式聚合酶链反应(pcr)对两种直接从土壤中同时检测方法。在现有的和新的引物条件下,根据内部转录间隔区(its)序列,已被评估为他们的特异性和使用的各种组合复用能力。加上这我们已经修改了一个机械裂解过程层土壤下从10克栗子提取dna(0.5~25μg dnaμg(1)新的土壤)。使用串行稀释和/或交联聚维酮色谱纯化,两个物种已被成功地检测到,在人为和自然感染的土壤。试验检测水平与其他疫霉物种的pcr为基础的诊断系统已被报道。针对传统的下料方法提出了定性评价。

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3. 研究的基本内容与计划

三、研究内容及计划

3.1方案拟定:科学合理,具有可行性。

论文时间安排:

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4. 研究创新点

四、特色与创新

核酸扩增技术是分子生物学领域的一项重要的研究手段,核酸扩增技术主要包括常规pcr 为基础的变温扩增技术以及等温扩增技术两大类。目前,基于常规pcr 为基础的变温扩增技术主要包括普通pcr、巢式pcr、多重pcr、实时荧光定量pcr等,这些技术在病原微生物的检测中发挥着重要的作用。由于核酸的变温扩增技术需要精密变温设备和高级复杂的分析仪器,或者对操作人员的熟练度和专业水平要求比较高,且反应时间长,不利于在基层推广,无法满足简单、快速、准确诊断的要求;而病原菌的防控关键在于对病原微生物的快速、准确、及早的检测并确诊。因此,建立一种快速、准确的新型的等温扩增技术对于植物病原微生物的诊断就显得尤为重要。等温扩增成为核酸扩增技术的一个研究热点,环介导等温扩增技术就是其中的一种。环介导等温扩增技术是2000年日本学者notomi等(notomi et al., 2000)建立了一种新的核酸等温扩增技术。自lamp检测技术建立13年以来,该技术已经广泛应用于对真菌、病毒、细菌、寄生虫等病原菌的检测研究。随着该技术体系的完善与发展,其在分子检测领域的应用也必将越来越广泛与深入。

技术路线

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