茯苓基因组生物信息学分析开题报告

1. 研究目的与意义

茯苓，俗称云苓、松苓、茯灵，为寄生在松树根上的菌类植物。

其原生物为多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核，多寄生于马尾松或赤松的根部。

产于云南、安徽、湖北、河南、四川等地。

2. 国内外研究现状分析

在过去的 30 年里， 作为最重要的生物医学研究手段之一， dna 测序技术自发明以来就一直在推动分子生物学发展方面起着至关重要的作用。

从早期 frederick sanger 的手工测序， 以及基于 sanger 法开发的第一代自动化测序仪， 到目前的下一代测序平台， 该领域已经发生了巨大的变化。

有人甚至将基因组测序技术的发展与半导体技术的发展相提并论, 这也不无道理。

3. 研究的基本内容与计划

研究内容:1. 茯苓基因组测序片段的拼接，组装；2. 茯苓基因预测，重复序列分析，microrna分析等；3. 茯苓基因组可视化。

实施计划:2010年第18周至2011第1周按照课题任务书要求收集、阅读相关文献资料，完成、提交毕业设计开题报告。

2011年第1-7周 基因序列拼装，基因预测，重复序列分析，microrna分析2011年第8-12周数据的可视化处理2011年第13-14周 书写毕业论文，上交毕业设计论文(包括电子版)。

4. 研究创新点

生物信息学是一门综合运用计算机科学、数学、物理学、信息科学等诸多学科的理论方法，进行生物信息的储存和分析，尤其是基因组、蛋白质组信息的获取、处理、储存、分析和解释的新兴学科。

借助其迅速发展，药用动植物的基因组学方面的研究将遇到极大机遇。

药用动植物的分子生物学研究包括：1.物种资源基因组信息研究；2.药用动植物作用的靶基因研究；3.基因表达谱与药用动植物作用机理及筛选；4.生物芯片技术与药用动植物作用机理研究；5.药用动植物的蛋白质组学的研究等。