1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
课题的意义：
表观遗传修饰对多倍体物种进化、调控亚基因组间基因表达的不平衡性具有重要作用。大豆原产于中国，是世界上最重要的蛋白质和油料作物，同时也是主要的固氮植物之一，目前大豆逐渐被应用于表观遗传修饰在多倍体植物基因表达调控中的作用的研究中。本研究利用免疫共沉淀技术，分析了h3k4me3修饰在逆境条件下中表达水平变化。因此，推测h3k4me3在相关基因表达中具有调控作用。
本项目利用大豆优良抗疫霉品种williams82作为实验材料，进行chip-seq，并进行生物信息学分析，进一步研究h3k4me3修饰在大豆基因组的分布，在基因表达中调控作用，对于阐述表观遗传修饰在基因表达中的调控作用具有重要意义。
2. 研究的基本内容和问题
研究的目标：
1.了解h3k4me3在大豆两个基因组中的分布模式
2.阐述h3k4me3在大豆相关基因表达过程的变化，及其调控作用。
3. 研究的方法与方案
研究方法：
利用实验材料：williams82，2n=20，取28天大豆苗（8片叶）0.5g叶片作为一个材料，每个材料一个input，一个chip，利用以上材料构建chip -seq文库，用h3k4me4的两个生物学重复构建chip-seq文库。进行高通量测序，利用mobaxterm进行数据分析，分析组蛋白修饰分布情况，确定组蛋白修饰对于基因表达是否有影响，若有影响确定什么基因，结合igvtool将组蛋白修饰的峰转换为可视化文件，分析具体作用机制。
4. 研究创新点
特色或创新之处
大豆是重要的二倍体作物，是是世界上最重要的蛋白质和油料作物,是进行多倍体组蛋白修饰研究的适宜材料。本项目使用大豆优良品种williams82为材料，研究多倍化表现型与表观遗传变化的关系，旨在揭示表观遗传修饰在基因表达中的作用。
在研究技术和手段上，本项目使用了前沿的生物技术，包括组蛋白修饰的染色体免疫荧光技术、chip-seq和生物信息学分析，为从基因组范围研究多倍体大豆的表观遗传修饰和基因表达的关系提供技术保障。并且将分子细胞遗传学技术与生物信息学分析相结合，揭示了每条染色体的h3k4me3核型。
5. 研究计划与进展
研究计划及预期进展
研究计划：
2019年5-6月：准备实验材料
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