水稻地方品种薄稻抗稻瘟病基因Pb-bd1候选基因在亲本间的序列差异分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1.意义：水稻属于世界上最重要的的粮食作物之一，由稻瘟病菌引起的稻瘟病是水稻最严重的病害之一，在世界各各个水稻生产国或地区每年都有不同程度的发生【1】。

严重影响水稻产量的穗瘟的抗性研究却鲜有报道。

薄稻是太湖流域地方抗穗瘟粳稻品种，前人研究结果表明该品种具有广谱抗稻瘟病基因(huan, et al. 2014; pei-fu, et al. 2007)。

2. 研究的基本内容和问题

目标：在pi-bd1进行精细定位的基础上，对pb-bd1的候选基因进行克隆与转基因验证。

内容：薄稻是太湖流域地方抗穗瘟粳稻品种，利用其与感病品种苏御糯已构建了ril群体，并进行了抗穗瘟qtl定位，根据粗定位的结果，我们将位于第11染色体上的抗性主效位点命名为pi-bd1，利用bc4f2群体，我们将其定位在了rm1233-bs59之间的30kb左右。

接下来，我们将预测pb-bd1中可能的候选基因并且进行克隆与验证。

3. 研究的方法与方案

1.研究方法：3.1 研究材料(1) 抗病地方粳稻品种：薄稻；感病品种：苏御糯。

(2) 群体材料：薄稻与苏御糯杂交获得后代f2群体。

(3) 试用菌株：hoku13.2 研究方法3.2.1 水稻穗瘟鉴定(1) 接种时间：阴天或傍晚；剑叶与倒二叶叶舌间距为5cm左右(2) 孢子液浓度：2-3105个/ml(刘水芳, et al. 2007)(3) 接种量：5-10ml(4) 接种方法：使用医院注射器（0.732mm）从包颈的叶鞘穗颈部位将菌液注入，直至菌液充满包穗(5) 调查时间：接种后第3周实验方案：一、实验材料流域地方抗穗瘟粳稻品种，利用其与感病品种苏御糯已构建的ril群体，在粗定位后已经将其定位于第11号染色体，接下来将利用bc4f3群体进行进一步的精细定位。

4. 研究创新点

Pi-bd1 是一个新的穗瘟抗性位点，通过对该基因精细定位与克隆，获得可能的稻瘟病抗性基因，同时，可将其导入到育种材料中，以用于育种生产。

5. 研究计划与进展

2016.6-2016.9 学习实验技能及了解稻瘟病及实验材料2016.9-2016.11 提取实验材料的DNA2016.11-2017.1 根据精细定位结果和得到的序列进行候选基因的克隆2017.1-2017.4 构建相应的候选基因转基因材料。

进行验证2017.4-2017.6 论文撰写及答辩