1. 研究目的与意义
研究背景:
由于线粒体中不同基因的进化速度不同,所以对于脊椎动物系统发育研究而言,其所具有的系统发育信息也不同。系统发育信息(phylogeneticinformation)也称作系统发生信息,是用于估算生物有关类群或亲缘关系远近的基因序列信息,一个基因所具有的系统发育信息的大小,可以通过该基因在重建系统发育树时的准确率来估算。自pcr技术和直接测序方法的广泛应用后,线粒体dna成为了系统发育研究的可靠标记。
自20 世纪以来,许多鱼类学家从鱼类的化石资料、形态结构和生理特征等方面探求鱼类的遗传进化历程,作出了令人瞩目的成绩,奠定了现代鱼类分类系统。但由于受多种客观条件,如缺乏化石标本、形态特征信息不足等的限制,使得传统的分类学方法在解决种内种间系统发生关系、物种起源、遗传分化及种群遗传结构研究等问题时往往显得证据不足。近年来,随着分子生物学技术向经典分类学领域的渗透,以及鱼类 mtdna 研究技术不断发展成熟,从而使得 mtdna 成为鱼类学相关研究的重要标记,并在鱼类进化遗传学、种群遗传结构、分子生态学和保护生物学等方面的研究中取得了很多有意义的成果,解决了许多疑难问题。
2. 研究内容和预期目标
主要研究内容:
基于12s rrna,16s rrna 和d-loop序列建树分析鲀属种间差异。
预期目标:
3. 研究的方法与步骤
研究方法:
1、线粒体基因组dna的提取与纯化
1.1、材料与试剂
4. 参考文献
[1] christian elmerot, ulfur arnason, takashi gojobori, et. the mitochondrial genome of the pufferfish, fugu rubripes, andordinal teleostean relationships[j]. gene, 2002 ,295: 163–172.
[2] 肖武汉, 张亚平. 鱼类线粒体dna 的遗传与进化[j]. 水生生物学报, 2000, 24(4): 228-236.
[3] 刘丽, 刘楚吾, 张明辉, 等. 不同保存条件下鱼类组织基因组dna的提取效果分析[j]. 广东海洋大学学报, 2007, 27(6):19-22.
5. 计划与进度安排
(1)2022-2022-1学期17-20周---2022-2022-2学期第1周(2022-3-1):接受任务书。查阅资料,确定所选基因,准备开题报告,外文论文翻译。
(2)第2周~第3周(2022-3-2~3-15):综合相关文献资料,撰写开题报告,
(3)第3周~第4周(2022-3-15~4-22):原材料制备,完成实验前准备工作,配制各实验所需药品;提取鱼的基因组dna和扩增线粒体相关基因(已完成)。
