1. 研究目的与意义
本课题研究的背景
卵巢癌是女性群体中发病率与死亡率最高的肿瘤之一，2018年全球新增发病人数为295414，死亡人数为184799。由于目前病因不明，且缺乏有效的前期检验手段，因此确诊时往往处于晚期，其死亡率在70%左右，晚期患者的五年存活率仅在30%左右。卵巢癌常发病于40-70岁绝经前后的妇女，患者全球均有分布，但西方人群发病率高于东方人群。卵巢癌分为卵巢上皮癌、性索间质肿瘤和生殖细胞类恶性肿瘤，根据手术病理分为1、2、3、4四期，发病时伴有腹胀、脱发、焦虑不安、潮热、盗汗、消瘦、烦躁易怒、感觉女性特征减弱等症状。
卵巢癌常见的诊断方法有盆腔检查、肿瘤标志物检查（ykl-40与ca125）、超声检查、放射性检查、细胞学检查等，这些方法缺乏早期有效检测卵巢癌所需的敏感性和特异性。在治疗方面主要是以细胞减灭术和术后化疗化疗为主，目前用的是国际妇产科协会 (figo) 的铂类为基础的联合化疗为治疗方案，但大多数患者会复发且具有铂抗药性。除此之外，还有紫杉醇化疗法、腹腔热灌注化疗治疗法、免疫细胞疗法等，但其预后效果都不佳。
microrna(mirna）是含有10-20多个碱基的短非编码序列，每个microrna都可调控数百个靶基因。microrna通过序列互补调节下游的mrna,其与植物结合会降解其mrna，与动物结合抑制mrna的翻译。在肿瘤发展过程中，microrna的异常表达既可以使抑癌基因失活，也可以激活癌基因，从而促进肿瘤的形成，由于microrna特异性强，因此microrna是潜在的有价值的生物标志物。microrna芯片可以获得microrna的差异表达并进行电脑分析，是一种非常重要的手段。
肿瘤标记物主要存在于血清之中，在正常细胞和肿瘤细胞中含量差距极大，可用于肿瘤的诊断和预后。目前已报道成熟的卵巢癌诊断标记有ca125，(糖类抗原125)、he4(人附睾蛋白)和opn(骨桥蛋白)等。ca125是应用最久的一种肿瘤标志物，最先于上皮卵巢癌中发现，可通过血清检验的方式检测其含量。在正常人中ca125的含量较低，卵巢癌患者的含量一般大于35u/ml。ca125最早被应用于卵巢癌的早期检测中，但是其特异性较差，一些妇科疾病中，如盆腔炎，卵巢囊肿也会导致ca125的含量增加。he4是一种酸性抑制性蛋白质，正常人体内低表达，卵巢癌患者含量一般大于150pmol/l，不同患者之间的表达存在着差异性。卵巢癌早期患者中he4的表达比ca125早大约三个月，其敏感性和特异性极佳，因此是被最广泛使用的肿瘤标志物。但是，ca125和he4的的含量还和年龄和月经状态相关，绝经后患者he4表达增高，绝经前ca125表达增高，因此moore等提出的卵巢恶性肿瘤风险模型 (roma) 成为可以高效的反应早期卵巢癌的指标，其提高绝经后ca125和绝经前he4在诊断中的比例，可以综合ca125和he4的优点，有效对卵巢癌进行诊断。opn是一种骨基质糖蛋白，在1979年由senger等人首次报道，在正常人中表达较低，在卵巢癌患者中表达较高，其敏感性高于ca125。opn可以促进细胞信号转导产生恶性肿瘤并使其恶化，与肿瘤的转移也有关。除此之外，卵巢癌的标记物还有循环游离（cfdna），循环肿瘤dna（ctdna）、循环肿瘤细胞等（ctc）、恶性肿瘤特异生长因子(tsgf)等。在基因水平上，opcml、runx3等基因与卵巢癌的发生有关。opcml是一种细胞黏附因子，runx3是一种肿瘤抑制基因，其甲基化均与卵巢癌的发生有关。除此之外，rialphamrna 与晚期卵巢癌也有密切关系。
与卵巢癌相关的通路有pi3k/ak通路、p53通路、wnt/β-catenin通路、tgf-microrna在卵巢癌的预后有着重要的作用，有助于在转录后水平了解卵巢癌的复发机制，也可作为判断卵巢癌复发的分子标记物。
目的及意义：
在本课题的研究中，我们将以卵巢癌microrna表达谱数据为研究对象，寻找复发样本中差异表达的microrna分子，并对其进行诊断力评价。进一步将microrna标记物分子调控的靶基因映射到分子通路，力争发现新颖的卵巢癌复发相关的分子信号通路，这些通路若经过进一步的实验验证，将为了解卵巢癌复β通路erk1/2-mmp通路和 jnk通路。pi3k/ak (酸脂酰三磷酸激酶/蛋白激酶b)通路中pik3ca增殖与突变、pine蛋白丢失，都与卵巢癌的发生有关。
microrna在卵巢癌的预后有着重要的作用，有助于在转录后水平了解卵巢癌的复发机制，也可作为判断卵巢癌复发的分子标记物。
2. 研究内容和预期目标
研究内容：
在本课题的研究中，我们将以结卵巢癌microrna表达谱数据为研究对象，寻找癌症样本中差异表达的microrna分子，并对其进行诊断力评价。此外，我们还将进一步将microrna标记物分子调控的靶基因映射到分子通路，并利用cytoscape构建microrna-mrna分子调控网络，寻找结卵巢癌中microrna调控的模块。
(1) mirna表达芯片数据的收集以及预处理；
3. 研究的方法与步骤
方法：
(一)根据论文题目，查阅相关文献。
包括正式出版的中外学术期刊和专著。从中选择10篇以上重点参考文献认真阅读，综合分析，写出文献综述，概括出最新研究进展与存在问题。在上述基础上，完成论文开题报告。
4. 参考文献
[1] xu, l., d. geman, and r.l. winslow, large-scale integration of cancer microarray data identifies a robust common cancer signature. bmc bioinformatics, 2007. 8: p. 275.
[2][2] cahan, p., et al., meta-analysis of microarray results: challenges, opportunities, and recommendations for standardization. gene, 2007. 401(1-2): p. 12-8.
[3][3] rhodes, d.r., et al., large-scale meta-analysis of cancer microarray data identifies common transcriptional profiles of neoplastic transformation and progression. proc natl acad sci u s a, 2004. 101(25): p. 9309-14.
5. 计划与进度安排
本论文的各阶段安排为：
1、2022-03-1～2022-03-09 接受任务，按照指导教师要求查阅资料，撰写开题报告。
2、2022-03-10～2022-03-23 进行数据收集，熟悉相关程序软件，数据的预处理等。
