1. 研究目的与意义
线粒体(mitochondria)是普遍存在于真核细胞中的细胞器,它通过氧化磷酸化进行能量转换,合成能源代谢物质——三磷酸腺苷(atp),为细胞的各项活动提供90%以上的能量,是细胞能量代谢的中心。近年来发现,线粒体还具有其他重要的生物学功能,包括调控细胞凋亡、参与细胞信号转导、生成活性氧等。线粒体dna(mitochondriondna , mtdna)是一条双链(h 链和l 链)超螺旋环状dna .目前mtdna 结构与功能的研究已成为分子进化、疾病诊断、细胞衰老与凋亡、经济性状等领域研究的有力工具
线粒体DNA是目前分子生物学研究的一个重要的领域,而鱼类mtdna是鱼类分子系统学研究和群体遗传分析的重要标记。
鲀科(tetraodontidae),是鲀形目下的一个分科,体长通常在200—300毫米,身体短粗偏向亚长椭圆形,头和吻短宽,有16个属约118种,从太平洋到大西洋均有所分布。
2. 研究内容和预期目标
研究内容:
1. 鲀科鱼类线粒体基因组模板准备;
2. 目的序列基因的克隆;
3. 研究的方法与步骤
3.1 暗纹东方鲀线粒体dna 的制备
活体解剖,取肝脏组织用酚-氯仿抽提法提取线粒体dna
3.2 分子量测定
4. 参考文献
[1] 刘丽, 刘楚吾, 张明辉, 等. 不同保存条件下鱼类组织基因组dna的提取效果分析[j]. 广东海洋大学学报, 2007, 27(6):19-22.
[2] 肖武汉, 张亚平. 鱼类线粒体dna 的遗传与进化[j]. 水生生物学报, 2000, 24(4): 228-236.
[3] 郭新红, 刘少军, 刘巧, 等. 鱼类线粒体dna 研究新进展[j]. 遗传学报, 2004 , 31(9) : 983- 1000.
5. 计划与进度安排
(1)2022-2022-1学期17-20周---2022-2022-2学期第1周(2022-3-11),接受任务书。查阅资料,确定所选基因(nd3、nd4l、atp8、atp8),准备开题报告,外文论文翻译。
(2)第2周~第4周(2022-3-12~4-1)综合相关文献资料,撰写开题报告,原材料制备,完成实验前准备工作,配制各实验所需药品;学习提取鱼的基因组dna和扩增线粒体基因nd3、nd4l。学会使用pcr仪,对pcr反应体系,循环参数进行摸索和调整等措施,学会制胶,学习制备感受态细胞,pcr目的基因。
(3)第5周~第12周(2022-4-2~5-27)完成pcr扩增产物的鉴定与割胶回收,回收纯化产物与载体连接,转化到感受态细胞中,利用白斑筛选阳性克隆,用质粒dna小量试剂盒提取质粒,用双酶切鉴定阳性菌落,阳性菌落质粒dna送到生物公司进行测序。
