1. 研究目的与意义
前列腺癌是指发生在前列腺的上皮性恶性肿瘤,是常见的男性恶性肿瘤之一。其高发于欧美国家,在美国男性肿瘤中的发病率占第一位,死亡人数排第二位。中国属于前列腺癌低发区,但近年来随着人们饮食结构改变、人均寿命延长及前列腺癌相关检测方法的改进,其发病率呈明显上升趋势,在男性泌尿生殖系统恶性肿瘤中,前列腺癌已跃居第二。与此同时,由于前列腺特异性抗原(psa)筛检的普及,早期、低级别或中级别的前列腺癌患者比例逐渐增高。
早期前列腺癌一般为激素依赖型,对雄性激素全阻断为主的内分泌治疗敏感,然而许多患者在接受雄性激素全阻断治疗后最终会发展为激素非依赖型前列腺癌。此种方式,导致患者对内分泌疗法产生耐受,肿瘤不断增殖、转移,最终导致患者死亡。
前列腺癌在临床和组织学上具有高度的异质性,有的患者可终身不发病而无需临床干预,有的患者则病程进展迅速需要积极的临床治疗;而目前临床所应用的psa、tnm分期以及gleason评分这些指标并不能完全对前列腺癌的进展及预后做出精准判断,临床上需要更多的生物分子标志物来联合精确地预测前列腺癌的生物学行为,从而制定更加合理的个性化治疗方案。
2. 研究内容和预期目标
研究内容:
在本课题的研究中,我们将以转移性前列腺癌microrna表达谱数据及其配对mrna表达谱为研究对象,寻找癌症样本中差异表达的microrna分子,并利用mrna表达谱对microrna候选标记物分子进一步优化,并对其进行诊断力评价。此外,我们还将进一步将microrna标记物分子调控的靶基因映射到分子通路,并利用cytoscape构建microrna-mrna分子调控网络,寻找转移性前列腺癌中microrna调控的模块。
(1) 基因表达芯片数据的收集以及预处理;
3. 研究的方法与步骤
1.检索各大基因表达谱数据库如arrayexpress(http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/)和gene expression omnibus(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/),转移性前列腺癌microrna表达芯片数据及其配对的基因表达芯片数据。
2. 整理芯片信息,选取转移性前列腺癌样本和正常样本进行对照的芯片信息,进行下一步分析。
3. 采用多种差异基因表达分析软件,包括most,ort,copa,os等,分别针对芯片数据寻找出在癌症样本中差异表达的microrna。
4. 参考文献
1.丁翔,崔凤梅,侯建全,等.前列腺癌患者血清微小rna表达谱的初步研究[j].中华泌尿外科杂志, 2015, 36(3):225-228.
2.赵琳,朱亚生,孙颖浩. microrna在前列腺癌中的研究进展[j].第二军医大学学报, 2016, 37(5):595-600.
3.叶林,宋希双.前列腺癌相关microrna的研究进展[j].中华医学杂志, 2010, 90(14):1001-1003.
5. 计划与进度安排
1、2022-2022-1学期17-20周~2022-2022-2学期第1周~第4周(2022-12-25~2022-03-23)接受任务,按照指导教师要求查阅资料,撰写开题报告。
2、第1周~第4周(2022-03-15~2022-03-28)进行数据收集,熟悉相关程序软件,数据的的预处理等。
3、第5周~第8周(2022-03-26~2022-04-20)不同统计方法寻找差异microrna的效果比较;择优采用统计算法选出疾病中差异表达microrna;
