1. 研究目的与意义
研究背景:
黑色素瘤(malinant melalonma,mm)是一种侵袭性极强的恶性肿瘤,其恶性程度较高且预后差,常见于皮肤或接近皮肤的黏膜,有时也见于软脑膜和脉络膜。黑色素瘤进展迅速,极易扩散转移,且有家族聚集现象。其发病率随人种、地域、种族的不同而存有所差异,白种人发病率明显高于黑种人,年老者的发病率远高于青少年。我国虽属黑色素瘤的低发区,但在过去20年间,其发病率呈持续上升趋势。在美国,每年都有近25000个恶性黑素瘤新增病例,死亡约6000人。
多数恶性黑素瘤均起源于正常皮肤的黑素细胞,约40%-50%发生于色素痣。黑色素痣受到反复的摩擦、抓起和损伤可能会引起恶变,不适当的挖除和药物腐蚀等,可使良性黑色素痣转化成恶性黑色素瘤。
2. 研究内容和预期目标
研究内容:
在本课题的研究中,我们将以黑色素瘤microrna表达谱数据及其配对mrna表达谱为研究对象,寻找癌症样本中差异表达的microrna分子,并利用mrna表达谱对microrna候选标记物分子进一步优化,并对其进行诊断力评价。此外,我们还将进一步将microrna标记物分子调控的靶基因映射到分子通路,并利用cytoscape构建microrna-mrna分子调控网络,寻找黑色素瘤中microrna调控的模块。
(1) 基因表达芯片数据的收集以及预处理;
3. 研究的方法与步骤
方法:
(一)根据论文题目,查阅相关文献。
包括正式出版的中外学术期刊和专著。从中选择20篇以上重点参考文献认真阅读,综合分析,写出文献综述,概括出最新研究进展与存在问题。在上述基础上,完成论文开题报告。
4. 参考文献
1.杨承勋,魏文斌.脉络膜黑色素瘤mirna表达谱的初步研究[j].中国科学:生命科学, 2010, 40(6):484-493.
2.刘忆南,邵蕾,魏文斌.不同病理类型的葡萄膜黑色素瘤中微小rna差异表达谱分析[j].中华实验眼科杂志, 2017, 35(9):778-785.
3.张琳西,易成刚,张旭东,等.用基因芯片表达谱筛选恶性黑色素瘤差异基因的研究[j].中国康复理论与实践, 2006, 12(8):694-695.
5. 计划与进度安排
1、2022-2022-1学期17-20周~2022-2022-2学期第1周~第4周(2022-12-25~2022-03-23)接受任务,按照指导教师要求查阅资料,撰写开题报告。
2、第1周~第4周(2022-03-15~2022-03-28) 进行数据收集,熟悉相关程序软件,数据的的预处理等。
3、第5周~第8周(2022-03-26~2022-04-20) 不同统计方法寻找差异microrna的效果比较;择优采用统计算法选出疾病中差异表达microrna;
