1. 研究目的与意义
背景
前列腺癌是男性的重要恶性肿瘤，每年在全球导致大量的男性死亡。通常是由患者前列腺的腺泡细胞生长无序、异常而导致的。转移性前列腺癌症属于前列腺癌症中的一种，它主要是指前列腺癌的癌细胞除在患者的前列腺被膜之内，还会转移到内脏、淋巴结、骨骼等患者身体的其他部位中，从而对患者的生命造成极大的威胁。在美国前列腺癌发病率占男性恶性肿瘤的第一位，死亡率占第二位，仅次于肺癌。我国前列腺癌发病率较低，但是近年来随着人民生活水平的提高、人口老龄化、饮食结构的变化以及医疗检测水平的提高，前列腺癌发病率正呈逐年上升趋势。目前认为，前列腺癌的发生、发展是一个涉及多因素、多步骤的异常复杂过程，不仅与遗传因素有关，还受年龄、种族、饮食习惯、环境因素的影响。前列腺癌的早期诊断对于前列腺癌的治疗具有重要临床意义。大约三分之一的前列腺癌具有侵袭性、发展迅速的特点，因此，前列腺的发生发展过程中的差异鉴定对于早期诊断和及时治疗前列腺癌具有重要意义。
基因芯片又称dna微探针阵列，是生物芯片中最为重要的一类。它利用信息集成和平行处理的原理，将已知特定的寡聚核苷酸序列或cdna片段作为探针，以原位聚合的方法，或者利用微量点样装置滴加在基片上的方法制备而成。通过碱基互补配对，将互补的靶核苷酸序列与其进行杂交，对杂交信号进行检测，进行定量或定性分析。与传统的生物技术相比，利用基因芯片，可以在同一次测试过程中对成千上万个基因进行分析，改变了传统方法只能对某一个基因或某几个基因进行研究的局限性，具有快速、高通量的优点。基因芯片技术在确定不同基因在表达上的相关性、探索基因的功能信息等方面具有重要应用价值。geo是世界上最大的储存高通量分子表达水平数据的公共数据库，用户可以提交、储存和检索多种形式的数据并免费使用。
2. 研究内容和预期目标
研究内容：
本文将全面检索公共基因表达芯片数据库，对转移性前列腺癌样本-正常样本的表达谱进行统计分析，寻找到高度可信并且可重复的转移性前列腺癌相关基因，并将这些基因映射到基因功能、分子通路，在系统水平分析这些基因的调控功能网络和模块。我们还将验证不同数据集的重要分子特征在通路水平的相似性高于基因水平的相似性这一假设。
(1)基因表达芯片数据的收集以及预处理；
3. 研究的方法与步骤
研究方法如下：
(一)根据论文题目，查阅相关文献。
包括正式出版的中外学术期刊和专著。从中选择10篇以上重点参考文献认真阅读，综合分析，写出文献综述，概括出最新研究进展与存在问题。在上述基础上，完成论文开题报告。
4. 参考文献
1.付旭平,曹明,莫文娟,等.利用小样本表达谱数据构造前列腺癌基因网络[j].复旦学报(自然科学版),2010(1):1-8.
2.盛霞.遗传性非息肉病性结直肠癌基因表达谱的初步研究[d].复旦大学,2010.
3.王刚,杨阔,孟帅,等.中国人前列腺癌发病关键基因的生物信息学研究[j].中华男科学杂志,2010,16(4):320-324.
5. 计划与进度安排
1、2022-2022-1学期17-20周～2022-2022-2学期第1周～第4周(2022-12-25～2022-03-23)接受任务，按照指导教师要求查阅资料，撰写开题报告。
2、第1周～第4周（2022-03-15～2022-03-28）进行数据收集，熟悉相关程序软件，数据的的预处理等。
3、第5周～第8周（2022-03-26～2022-04-20）不同统计方法寻找差异基因的效果比较；择优采用统计算法选出疾病中差异表达基因；
