1. 研究目的与意义
食道癌( esophageal carcinoma)是目前世界上最普遍的胃肠道恶性肿瘤之一，死亡率位居癌症第4名，主要包括鳞状细胞癌(scc) 和食道腺癌(eac) 两种。其中鳞状细胞癌所占的比例高达90%。我国是食道癌高发地区，年平均死亡人数约15万人，占全国肿瘤死亡率21.8 %［1］。
吸烟和饮酒是食道癌的已知主要危险因素，对致癌起协同作用。长期吸烟摄入的致癌物和酒精代谢产物醛都会损伤dna并导致一系列遗传变化。先天的遗传因素也是重要的影响之一。此外，温度超过70摄氏度的过热食物会加速食道细胞的脱落，再生过程，增加细胞发生突变的概率。食管癌常见症状为吞咽不适、疼痛、胸口疼痛、体重下降、慢性出血等。
目前食管癌的治疗方案有手术治疗、放射治疗和化学治疗等。手术是主要的食管癌疗手段，然而单独的手术治疗往往局部控制不佳和长期预后不良。单纯手术治疗非转移性escc的5年生存率为10-40％[2]。放射治疗利用电离辐射作用对肿瘤进行治疗，通过精确控制辐射剂量在杀死肿瘤细胞的同时尽量减少对正常细胞和组织的损害。化疗是远处转移患者的标准治疗方式，常用的化学药物有阿霉素(adm)、5-氟尿嘧啶(5-fu)、甲氨蝶呤(mtx)、顺铂(ddp)、开普拓(cpt-11)等，常用的联合化疗的方案是ddp与5－fu的联合，ddp能增加乏氧细胞敏感性，抑制亚致死性损伤的修复和潜在致死性损伤的修复，5-fu 可杀死肿瘤细胞改变肿瘤细胞增殖动力学，增强放射敏感性[3]。辅助化疗后患者总生存率显著提高，相对死亡风险降低13％，2年生存率增加5.1％[4]。
2. 研究内容和预期目标
研究内容：
本文将全面检索公共基因表达芯片数据库，对多套食管癌样本-正常样本的表达谱进行荟萃分析，寻找到高度可信并且可重复的食管癌相关基因，并将这些基因映射到基因功能、分子通路，在系统水平分析这些基因的调控功能网络和模块。我们还将验证不同数据集的重要分子特征在通路水平的相似性高于基因水平的相似性这一假设。
(1) 基因表达芯片数据的收集以及预处理；
3. 研究的方法与步骤
1. 检索各大基因表达谱数据库如arrayexpress（http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/）和geneexpression omnibus(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)，收集食管癌基因表达芯片的数据。
2. 整理芯片信息，选取食管癌不同的样本进行对照的芯片信息，进行下一步分析。
3. 采用多种差异基因表达分析软件，包括most，ort，copa，os等，分别针对每一组芯片数据寻找出在癌症样本中差异表达的基因。
4. 参考文献
[1] kojima t, doi t. immunotherapy for esophageal squamouscell carcinoma[j]. current oncology reports, 2017, 19(5):33.
[2] liu y, xiong z, beasley a, et al. personalized andtargeted therapy of esophageal squamous cell carcinoma: an update[j]. annals ofthe new york academy of sciences, 2016, 1381(1):66-73.
[3] 白海鹏, 孙维敏, 康娜. 食道癌及其治疗的研究进展[j]. 包头医学院学报,2014(3):134-136.
5. 计划与进度安排
1、2022-2022-1学期17-20周～2022-2022-2学期第1周～第4周(2022-12-25～2022-03-23)接受任务，按照指导教师要求查阅资料，撰写开题报告。
2、第1周～第4周（2022-03-15～2022-03-28） 进行数据收集，熟悉相关程序软件，数据的的预处理等。
3、第5周～第8周（2022-03-26～2022-04-20） 不同统计方法寻找差异基因的效果比较；择优采用统计算法选出疾病中差异表达基因；
