16s rRNA和Cytb基因序列对鲀科分类有效性初探开题报告

1. 研究目的与意义

背景：东方鲀属fugu是鲀科各属鱼类中的典型代表。鲀科鱼身体一般呈椭圆形或者短圆形，体表光滑或者有小刺，头背宽圆；有1个与臀鳍形态相似的背鳍在与臀鳍相对的位置，没有腹鳍；上下颌骨牙形成4个喙状牙板，中央缝显著。鲀科在世界各地分布较广，品种较多，约有200余种，其中在我国就有40余种，大部分属东方鲀属，主要分布在黄海、渤海、东海、南海以及近海江河中，是江海洄游习性的底栖鱼类。

鲀科各属鱼类是一种重要的洄游性鱼类。其肉质细嫩，肉味腴美，营养丰富，虽然其内脏及血液中却含有大量毒素，仍然是我国北方海区主要经济鱼类之一，也是长江中一种具有重要经济价值的渔业资源。河豚毒素即ttx，具有镇痛、局麻、解痉等多方面的药理作用，而且患者不会成瘾，具有很高的药用价值，随着人们对其研究的深入，进入临床广泛使用指日可待。

毕潇潇等人通过鳕鱼线粒体16s rrna和cytb基因序列的比较研究发现在鳕鱼体内cytb进化速率较16s rrna快，通过构建的nj系统树得出了狭鳕、太平洋鳕、蓝鳕和远东宽突雪4种鳕鱼的亲缘关系。乔慧莹也通过cytb基因序列探讨了中国沿海银鲳的种群遗传结构。杨玲等通过对泰山螭霖鱼线粒体的16s rrna基因部分序列的分析，探讨其与鲤科7个属鱼类的进化关系。张玉波等人通过联合17种东方鲀属鱼类的cytb和12s rrna基因全序列研究了东方鲀属鱼类的系统发育关系。张俊丽等人则探讨了在16s rrna和cytb基因中，cytb基因更适用于白鲑的分子系统发育研究，并基于该序列利用kimura-2模型构建了nj树表明了3种白鲑鱼的亲缘关系。

2. 研究内容和预期目标

在核酸分子水平上对鱼类进行种质鉴定、多样性评估，并探讨它们的亲缘关系和系统演化，是目前鱼类遗传育种、资源评估和起源进化研究最有效的手段。研究将为探索鲀科种间的分子遗传距离和相对亲缘关系，进一步深入研究鱼类分子进化提供有价值的实验数据。研究结果也将为进一步深入研究鲀科鱼类线粒体基因组的结构与功能、鱼类分子进化、种群间的联系打下基础。本文拟选取鲀科鱼类组织细胞的线粒体基因16 s rrna和cytb进行研究，采用pcr方法，从东方鲀属鱼类组织细胞中克隆目的基因序列并测序，进行相关生物信息学分析和系统发育的分析。

预期目标：

提取16 s rrna和cytb基因并进行扩增

3. 研究的方法与步骤

（一）线粒体基因组dna的提取和纯化；

1.1 实验材料和主要试剂

4. 参考文献

[1] 刘丽, 刘楚吾, 张明辉, 等. 不同保存条件下鱼类组织基因组dna的提取效果分析[j]. 广东海洋大学学报, 2007, 27(6):19-22.

[2] 肖武汉, 张亚平. 鱼类线粒体dna 的遗传与进化[j]. 水生生物学报, 2000, 24(4): 228-236.

[3] 郭新红, 刘少军, 刘巧, 等. 鱼类线粒体dna 研究新进展[j]. 遗传学报, 2004 , 31(9) : 983- 1000.

5. 计划与进度安排

1、

1、2022年11月20日---2022年1月10日：确定论文选题，与指导教师见面。查阅相关文献。

2、2022年1月11日---2022年2月13日：接受任务书。

3、第1-2周（2022年2月20日---2022年3月5日）：阅读文献及相关资料，为开题报告做准备。