基于基因表达芯片的急性淋巴细胞白血病相关信号通路分析开题报告

 2022-03-01 07:03

1. 研究目的与意义

本课题研究的背景:

急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,all)是一种由b系或t系淋巴细胞在骨髓内异常增生而引发的恶性肿瘤性疾病。急性淋巴细胞白血病包括多个不同的免疫表型和分子特征,其临床特征为在血液、骨髓、淋巴结、脾脏和其它器官中可检出大量类似淋巴母细胞的未成熟白细胞。急性淋巴细胞性白血病占儿童急性白血病的80%,发病率高峰在3岁至7岁之间,也可发生于成年人,占所有成年人白血病发病率的20%。国际上多项研究报道显示,目前成人急性淋巴细胞白血病的完全缓解(cr)率已可达到70%-90%,但复发率较高,长期生存(os)率约为30%-40% ,

近年来,随着高通量基因芯片技术的发展,人们可通过基因表达谱鉴定特定疾病状态和生理条件的分子标记物,因此对急性淋巴细胞白血病生物学认识逐渐深入。基因芯片(gene chip)将大量特定的寡核苷酸探针分子有序地、高密地固定于支持物上,然后与经标记样品进行杂交,通过检测杂交信号的强度及分布进而对靶分子的序列和数量进行分析。基因芯片检测可采用多种方法将寡核苷酸或短肽固定到固相支持物上。这些方法总体上可分为两类,即原位合成与合成点样。固相合成技术是当前多肽、核酸人工合成中普遍使用的方法,技术成熟且已实现自动化。通常原位合成方法仍然比较复杂,除了在基因芯片研究方面享有盛誉的 affymetrix 等公司使用该技术合成探针外,其它中小型公司大多使用合成点样法。20 世纪70 年代之前,细胞形态学、细胞化学是急性淋巴细胞白血病唯一的诊断工具,此后逐渐发展为细胞形态学、细胞化学、细胞遗传学(常规细胞遗传学)、免疫表型(多参数流式细胞术(mfc))、分子细胞遗传学(荧光原位杂交(fish))、比较基因组杂交技术、分子生物学(pcr和测序)等相结合的综合诊断模式。

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2. 研究内容和预期目标

研究内容:

本文将全面检索公共基因表达芯片数据库,对多套急性淋巴细胞白血病样本-正常样本的表达谱进行荟萃分析,寻找到高度可信并且可重复的急性淋巴细胞白血病相关基因,并将这些基因映射到基因功能、分子通路,在系统水平分析这些基因的调控功能网络和模块。我们还将验证不同数据集的重要分子特征在通路水平的相似性高于基因水平的相似性这一假设。

(1) 基因表达芯片数据的收集以及预处理;

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3. 研究的方法与步骤

方法:

(一)根据论文题目,查阅相关文献。

包括正式出版的中外学术期刊和专著。从中选择20篇以上重点参考文献认真阅读,综合分析,写出文献综述,概括出最新研究进展与存在问题。在上述基础上,完成论文开题报告。

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4. 参考文献

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5. 计划与进度安排

本论文的各阶段安排为:

1、2022-03-1~2022-03-09 接受任务,按照指导教师要求查阅资料,撰写开题报告

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