1. 研究目的与意义
1.1研究背景
癌症具有细胞分化和增殖异常、生长失去控制、浸润性和转移性等生物学特征,其发生是一个多因子、多步骤的复杂过程,分为致癌、促癌、演进三个过程,与吸烟、感染、职业暴露、环境污染、不合理膳食、遗传因素密切相关。癌症因其高发病率和高死亡率,严重危害人民群众的身心健康。仅以乳腺癌为例,我国每年大约新增乳腺癌患者27.9万例,位居女性肿瘤发病率首位。虽然乳腺癌患者的5位存活期已提升至80%左右,但与欧美发达国家相比,仍有较大的提升空间。信号传导及转录激活蛋白(signal transducer and activator of transcription),即stat。是一种能与dna结合的蛋白质独特家族。通常对各种细胞外的细胞因子和生长因子信号做出应答,是一类含有能与磷酸化酪氨酸结合的sh2信号分子。stat是核内转录因子。但在静息细胞中,stat存在于胞质中。stat分子被激活后,形成二聚体进入细胞核。参与调控基因表达特别是在ifn作为信号分子的细胞中,stat可以被激活,作为一种被诱导的转录因子,表现出多种特异的功能。stat含有sh2和sh3结构域,可与特定的含磷酸化酪氨酸的肽段结合。当stat被磷酸化后,发生聚合成为同源或异源二聚体形式的活化的转录激活因子,进入胞核内与靶基因启动子序列的特定位点结合,促进其转录。
2. 研究内容和预期目标
1. 从pdb中,找寻stat3蛋白的晶体结构;
2. igemdock、poseview分析隐丹参酮与stat3蛋白的结合位点;
3. 根据上述结果,对隐丹参酮的侧链基团进行虚拟改造,设计衍生物;
3. 研究的方法与步骤
a. 查阅文献,写出开题报告(第1-2周)
根据论文题目,查阅正式出版的中外学术期刊和专著,从中选择10篇以上参考文献(外文1-2篇),认真阅读,深刻理解,综合分析,掌握其最新动态,参照论文设计任务书的研究内容,写出开题报告(包括文献综述、选题目的和意义、研究方案、计划进度、参考文献)。论文撰写的格式按照院统一标准。如参考文献要列出作者姓名(多人的取前三名)、论文标题、发表刊物、时间、卷(期)及起止页码。在查阅的文献中选1篇外文(5000以上外文印刷字符、文献内容要结合本研究内容)全文翻译为中文。
b. 实验研究前期准备工作(7周前)
4. 参考文献
1.Shan X, Fu YS, Aziz F, et al. Ginsenoside Rg3 inhibits melanoma cell proliferation through down regulation of histone deacetylase 3(HDAC3) and increase of p53 acetylation.PLoSOne. 2014, 9(12): e115401.
2.Waterman C,CalculL, Beau J, et al. Miniaturized cultivation of microbiota for antimalarial drug discovery. Med Res Rev. 2014, doi:10.1002.
5. 计划与进度安排
第1-2周 查阅文献,完成开题报告的撰写。
第3-4周 找寻stat3蛋白晶体结构,并分析其和隐丹参酮的结合机制和位点;
第5-7周 对隐丹参酮侧链基团进行改造;
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