COVID-2019冠状病毒的Spike蛋白的晶体结构预测及其抑制剂筛选开题报告

 2022-03-12 03:03

1. 研究目的与意义

1.1研究背景

冠状病毒,是被包膜的rna病毒,广泛分布于人类,其他哺乳动物和鸟类中,可以引起呼吸系统,肠道,肝脏和神经系统疾病。此前,已知六种冠状病毒会引起人类疾病。229e,oc43,nl63和hku1四种病毒在宿主体内普遍存在,通常会在具有免疫能力的个体中引起普通感冒症状。其他两毒株-严重急性呼吸系统综合症冠状病毒(sars-cov)和中东呼吸综合征冠状病毒(mers-cov)属于人畜共患病毒,有一定致命性。sars-cov是2002年和2003年中国广东省严重急性呼吸道综合症暴发的病原体;mers-cov是导致2012年中东地区严重呼吸道疾病暴发的病原体。由于冠状病毒的高流行和广泛分布,其本身的多样性和基因组的频繁重组等因素,以及人与动物之间的接触不断加强,新型冠状病毒很可能会定期在人体内出现。

2019年底,中国爆发了新型冠状病毒感染肺炎疫情,此次疫情的元凶来自一种新型冠状病毒,2019-ncov。该病毒为人体中发现的冠状病毒新毒株,病毒最早于武汉华南海鲜市场被发现。该病毒引发的症状一般为发热、乏力、干咳等、逐渐出现呼吸困难,严重者表现为急性呼吸窘迫综合征,脓毒症休克,难以纠正的代谢性酸中毒和凝血功能障碍。该病毒已确认存在人传人现象,且潜伏期具有传染性,所致疾病没有特异治疗方法。

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2. 研究内容和预期目标

1.根据spkie蛋白的mrna序列,预测晶体结构;

2.结合已知的ace2的结合位点,分析spike蛋白的功能域;

3.从已知文献中找寻白术、蔓荆子、枇杷叶等不同中草药的有效成分;

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3. 研究的方法与步骤

见上述

4. 参考文献

1.Shan X, Fu YS, Aziz F, et al. Ginsenoside Rg3 inhibits melanoma cell proliferation through down regulation of histone deacetylase 3(HDAC3) and increase of p53 acetylation. PLoS One. 2014, 9(12): e115401.

2. Waterman C, Calcul L, Beau J, et al. Miniaturized cultivation of microbiota for antimalarial drug discovery. Med Res Rev. 2014, doi:10.1002.

5. 计划与进度安排

2022-2022-2学期

第1-2周 查阅文献,完成开题报告的撰写。

第3-4周 预测spike蛋白晶体结构,并分析其功能域;

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