蓝莓FAD蛋白的生物信息学分析开题报告

1. 研究目的与意义

蓝莓是一种具有独特保健作用和高营养价值的落叶果树，果实中含有多种生物活性物质,如花青素、鞣花酸和紫檀芪等,有较强的营养保健功效,被世界卫生组织认为是抗氧化性最强的水果之一,常被誉为“浆果之王”。蓝莓中的叶酸、熊果酸等物质对血管软化和高血压患者有很好的疗效,而花青素有非常明显的抗炎和消炎作用，同时花青素、鞣花酸和紫檀芪这些活性成分又可以抑制多种癌细胞的生长并促进其凋亡,包括胃癌、前列腺癌、结肠癌和乳腺癌等,是优良的天然抗癌物质。蓝莓的市场因其价值被逐渐发现而扩大，为了提高蓝莓产量，需要对蓝莓植株进行改良，其中增强其抗寒能力能让蓝莓植株更好地应对低温胁迫。

为了增强蓝莓植株的抗寒能力，对植物体内不同成分进行比较和实验，经多项研究证明膜脂中多不饱和脂肪酸的含量在高等植物抗寒中起重要作用，膜脂不饱和脂肪酸含量增高，膜脂相变温度会降低，增加了膜的流动性，从而使植物的抗寒性相应提高。植物体内饱和脂肪酸在脂肪酸去饱和酶的作用下引入双键即形成不饱和脂肪酸。于内质网上的油酸去饱和酶fad2和亚油酸去饱和酶fad3是植物产生多聚不饱和脂肪酸的关键酶。油酸去饱和酶fad2的重要功能就是向油酸(c 18∶1)引入第二个双键，提供质膜结构所需的亚油酸(c18∶2)多元不饱和脂肪酸；亚油酸去饱和酶fad3的重要功能就是提供质膜结构所需的亚麻酸(c18∶3)多元不饱和脂肪酸，由此得出脂肪去饱和酶是调控不饱和脂肪酸的关键，因此许多实验围绕脂肪酸去饱和酶展开。

由于脂肪酸去饱和酶在蓝莓的发育中起到对不饱和脂肪酸的调控作用，从而影响蓝莓植株的抗寒能力，本实验希望通过对蓝莓vcfad基因的生物学信息分析，为后续蓝莓抗寒育种研究提供基础资料。

2. 研究内容和预期目标

1.蓝莓vcfad基因与蛋白序列的同源性分析；

（1）分析蓝莓vcfad同源基因保守区

（2）将蓝莓vcfad基因与蛋白序列和其他物种的同源基因序列进行聚类分析，构建进化树。2.蓝莓vcfad基因编码氨基酸序列分析；

3. 研究的方法与步骤

1.蓝莓vcfad基因与蛋白序列的同源性分析； （1）利用ncbi的分析工具（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/conserved domain）对基因进行分析。

（2）在dnaman中对目的基因进行聚类分析。

（3）利用文献、资料对目标基因进行查询。

4. 参考文献

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5. 计划与进度安排

（1）2022年11月10日至2022年12月20日：与指导老师见面，讨论，确定论文选题； （2）2022年12月23日至2022年2月23日（第1周前）：接受毕业论文任务书；查阅文献资料；（3）2022年2月24日至2022年3月09日（第1周~第2周）：撰写开题报告，完成开题；完成外文文献翻译初稿； （4）2022年3月10日至2022年4月3日（第3周~第6周）：熟悉相关生物信息学分析方法与数据处理方法；并对不同的方法进行对比分析，及时调整分析方案；（5）2022年4月6日至2022年5月10日（第7周~第11周）：完成全部生物信息学分析，对研究结果进行总结和绘制图表；提交外文翻译；（6）2022年5月11日至2022年6月5日（第12周~第15周）：整理数据，根据基因特性深入分析，撰写论文初稿；（7）2022年6月10日至2022年6月14日（第16周）：提交数据和图表，毕业论文修改、定稿与毕业答辩。