棉花PAL基因的生物信息学分析开题报告

 2022-05-22 08:05

1. 研究目的与意义

棉花是世界上最主要的农作物之一,产量大、生产成本低,使棉制品价格比较低廉。棉纤维能制成多种规格的织物,从轻盈透明的巴里纱到厚实的帆布和厚平绒,适于制作各类衣服、家具布和工业用布。棉织物坚牢耐磨,能够洗涤和在高温下熨烫,棉布由于吸湿和脱湿快速而使穿着舒服。如果要求保暖好,可通过拉绒整理使织物表面起绒。通过其他整理工序,还能使棉织物防污、防水、防霉;提高织物抗皱性能,使棉织物少烫甚至不需要熨烫;降低织物洗涤时的缩水,使缩水率不超过1%。

预计2022年,全球棉花消费量较基准期(2010-2012 年均值)提高约17.9%至0.28 亿吨,产量较基准期提高3.9%到0.27 亿吨,棉花期末库存量将提高约260 万吨至0.16 亿吨。可见棉花在未来一段时间仍是全球重要的经济作物之一。

但是棉花生长过程中经常遇到一些病害,比如:黄萎病、棉苗立枯病、棉枯萎病等,特别是黄萎病可能给棉花生产带来重要的危害。如何从基因层面防治棉花病害,从而提高棉花的产量和品质,是近几年很多学者的研究内容。

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2. 研究内容和预期目标

研究内容:

本研究根据前期所获得的棉花pal基因序列为基础,进行该蛋白的生物信息学分析,为后续功能研究提供基础的资料。

(1)pal序列同源性分析;

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3. 研究的方法与步骤

(1)pal序列同源性分析;

利用在线的http://www.ncbi.nlm.nih.gov/conserved domain,分析pal同源基因保守区。将pal基因和其他物种的同源基因的蛋白序列在dnaman中进行聚类分析,构建进化树,判断其进化渊源。

(2)pal蛋白的编码氨基酸序列分析;

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4. 参考文献

1. wang y, wang y, li j, li sj, chu h, tian xf. cloning,prokaryotic expression and bioinformatics analysis of giardia lamblia c2strain sumogene[j]. chinese journal of zoonoses. 2013. 8

2. 吴组建,高芳銮,沈建国.生物信息学分析实践[m].北京:科学出版社, 2010.

3. 张成岗,贺福初.生物信息学—方法与实践[m].北京:科学出版社, 2002.

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5. 计划与进度安排

(1)2022年10月19日至2022年12月25日:与指导老师见面,确定论文选题;

(2)2022年12月26日至2022年1月26日:接受毕业论文任务书;

(3)2022年2月16日至2022年3月10日:查阅文献资料,撰写开题报告,完成开题;

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