油菜中HMA家族蛋白受镉胁迫的生物信息学分析与鉴定开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

课题的意义、国内外研究进展、应用前景等（列出主要参考文献）一． 本课题的意义镉（cadmium，cd）是生物毒性最强的重金属元素之一，不是植物体生长必需的元素。

正常情况下，土壤环境中镉元素的含量较低[1]，不会达到有害的程度。

但随着工业化、城镇化的快速发展，我国土壤环境的镉含量超标状况日趋严重[2]，而且重金属污染土壤的治理和修复难度大、成本高。

2. 研究的基本内容和问题

研究的目标、内容和拟解决的关键问题一．研究的目标、内容 本实验利用生物信息学知识探索油菜中hma家族蛋白的功能，通过研究不同hma蛋白对油菜中镉胁迫的响应，镉的吸收和积累，亚细胞分布的影响，揭示了不同hma家族蛋白对于镉胁迫处理的差异表达，进而有望通过人为调控hma家组蛋白的表达，提高油菜对镉的耐性，减少对镉的吸收，应用于镉污染区的植物修复和农业生产。

二．研究的内容通过生物信息学知识对油菜中hma家族蛋白进行筛选，探究不同hma家组蛋白对于油菜中镉胁迫的调控作用，并通过差异分析和实时荧光定量pcr进行实验验证。

三．拟解决的关键问题比较不同hma家族蛋白对于油菜中镉胁迫的调控，探究不同蛋白调控对镉的吸收和积累作用。

3. 研究的方法与方案

研究方法、技术路线、实验方案及可行性分析一． 研究方法与实验方案1.根据已知拟南芥hma家族蛋白序列具有的保守结构域（来自pfam网站）对比油菜库，利用软件smart分析验证hma家族蛋白结构域的存在,通过全基因组筛选确定油菜hma基因家族成员。

2.利用软件mega6.0构建旁系同源进化树，分析同源关系，并根据不同的油菜hma家族蛋白特性，进行命名。

3.在brassicadb网站检索油菜hma基因家族成员,而后通过本实验室油菜库筛选。

4. 研究创新点

特色或创新之处一．本实验着重对生物信息学的运用，旨在于能快速筛选出目标基因以用于后续生物学基础功能的研究做好充足的准备和完善的分析，减少了后续实验中很多不必要的环节，并且进行反复验证，做到确保实验结果的正确性。

二．利用荧光定量PCR验证HMA家族蛋白对镉胁迫的响应，目前对于油菜基因蛋白的研究鲜少，本实验结果及数据在国内外的科研领域有拓展性作用。

5. 研究计划与进展

研究计划及预期进展起止时间工作内容预期进展2017.9-2018.1在指导老师的帮助下进行选题，题目初步定为油菜中hma家族蛋白对镉胁迫的响应选题2017.12-2018.1查阅国内外相关文献，并进行思考和总结。

文献综述2018.1-2018.3完成生物信息学的筛选，确定试验计划，做出可行性分析和调研报告，制定实验流程，并且预期实验结果。

开题报告2018.3-2018.4通过实验验证生物信息学结果，完成中期报告，纠正实验中有问题的部分，并及时作出改动。