1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
平胸总目（现存类群包括分布在非洲鸵鸟，美洲驼鸟，鸸鹋，食火鸡和几维鸟（鹬鸵））是今鸟亚纲中最为独特的一个族群，其在今鸟亚纲中的原始地位备受争议，而其本身能否构成系统发生学中单系群(monophyly)也颇受质疑[1]。由于该族群的现存种无法通过飞行来进行长距离的迁徙，故而其分布和扩散长久以来被认为与冈瓦纳大陆的分裂相关。
然而最近的基于线粒体基因组和多核蛋白位点的研究表明平胸总目并非单系群，而是与分布在中、南美的形目鸟类相互嵌合[2]，故而经典的平胸总目事实上是一个并系。并且结合分子定年和板块构造分析的研究表明该类群的祖先可能具有飞行能力，在其谱系内部也有部分灭绝种类可以进行跨洋飞行[3]。最近的研究则通过测量了新西兰恐鸟和马达加斯加象鸟的古dna序列证明现存的分布在新西兰的几维鸟是非洲象鸟的姊妹群，并且在50mya才发生分歧，这一惊人的结论证明其共同祖先是通过长距离的跨洋扩散才从非洲大陆抵达新西兰的[4]，这再次说明其祖先类型是可以飞行的类群。
对平胸总目飞行能力的研究可以通过与之前的形态学或分子学数据结合，完善鸟类系统发生学中最重要的缺失环节，并与冈瓦纳大陆分裂等对物种演化影响深远的地史事件关联分析，从而加深人们对鸟类进化的理解。
2. 研究的基本内容和问题
运用现存类群的DNA数据和部分灭绝类群的古DNA的线粒体基因序列构建并验证或推翻之前获得的系统发育关系，并基于化石矫正点进行分子定年，最后通过祖先状态重建和冈瓦纳大陆的构造时序变化的综合分析为不飞鸟在冈瓦纳大陆的扩散和丧失飞行能力过程提供出一种最为合理的假说。
3. 研究的方法与方案
研究方法：
通过筛选出的来源于线粒体蛋白和核蛋白的基因序列矩阵通过分区贝叶斯法和似然法解析平胸总目之间的演化关系，并基于可靠的化石矫正点利用宽松贝叶斯方法进行分子定年，并根据对平胸总目鸟类地理状况的重建判断平胸总目鸟类的飞行能力与冈瓦纳大陆迁移之间存在的关系。
技术路线：
4. 研究创新点
运用现存类群和部分灭绝类群的古DNA的线粒体基因序列构建并验证之前获得的系统发育关系，并基于化石矫正点进行分子定年，最后通过祖先状态重建和冈瓦纳大陆的构造时序变化的综合分析为平胸总目鸟类在冈瓦纳大陆的扩散和丧失飞行能力过程提供出一种最为合理的假说
5. 研究计划与进展
2014.12-2015.1筛选获得基因序列，进行单基因序列的同源比对；
2015.1-2015.2进行基因数据饱和度检测，并拼接序列和生成数据集；
2015.2-2015.3系统发育分析，并选择化石矫正点进行贝叶斯分析获得初步的分子定年结果；
