TMS5相互作用蛋白的酵母双杂交筛选开题报告

 2022-02-07 17:25:41

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

(1)课题意义水稻是世界上最重要的粮食作物之一,是世界2/3以上人口的主粮。

在中国杂交水稻种植面积约占水稻种植总面积的60%。

与常规水稻相比,杂交水稻提高了约20%-30%的产量,因此杂交水稻对水稻的增产做出了重要的贡献[1]。

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2. 研究的基本内容和问题

(1) 研究目标实验室前期的研究表明rnase zs1可能参与对ubl40 mrna的加工,我们希望通过筛选互作蛋白探索rnase zs1在体内酶活功能发挥机理,进一步阐释水稻rnase zs1在体内参与温度响应的分子机制。

(2) 研究内容1、收集株1s的自然回复突变体mb101高温(26℃)处理过下4-6mm的小花;2、提取总rna,分离纯化mrna,;3、构建tms5-pgbkt7载体;构建mb101的cdna文库,; 4、通过酵母双杂交筛选与rnasezs1相互作用的蛋白。

(3) 拟解决的关键问题植物响应外界温度变化的过程是复杂而又敏感的,实验室前期的研究表明rnase zs1可能参与对ubl40 mrna的加工,从而影响水稻的育性。

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3. 研究的方法与方案

(1) 研究方法和实验方案1、收集株1s的自然突变体mb101高温(26℃)处理过下4-6mm的小花;并提取总rna,分离纯化mrna,;2、构建tms5-pgbkt7载体;构建mb101的cdna文库,; 3、制备酵母感受态并进行转化,通过western检测目的蛋白表达的情况,并对目的蛋白进行毒性检测和自激活检测;4、通过酵母双杂交筛选与rnasezs1相互作用的蛋白;4、将初步确定的阳性克隆提取质粒后转入了大肠杆菌dh5α中,并进行菌落pcr检测这些阳性克隆是否有片段插入pgadt7载体。

5、根据菌落pcr结果提取大肠杆菌的质粒进行pcr测序反应,得到靶基因序列,通过生物软件比对,对初步得到的结果做好统计。

6、挑选感兴趣的基因进行反向酵母双杂交检测(将靶基因连到pgbkt7载体上,同时将jmj14连到pgadt7载体上,进一步验证两者相互作用的情况。

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4. 研究创新点

植物和外界环境相互作用是十分复杂和敏感调控网络,我们通过研究植物转录后水平响应温度变化的分子机理研究,进而探索温敏核雄性不育分子机制。

5. 研究计划与进展

(1)2015年7、8月:收集株1s的自然突变体mb101高温(26℃)处理过下4-6mm的小花(2)2015年9月:提取总rna,分离纯化mrna(3)2015年10月:构建tms5-pgbkt7载体;构建mb101的cdna文库(4)2015年11、12月:酵母感受态制备,进行转化,通过酵母双杂交筛选与rnasezs1相互作用的蛋白(5)2016年1月:阳性克隆检测。

将初步确定的阳性克隆提取质粒后转入了大肠杆菌dh5α中,并进行菌落pcr检测了部分克隆是否有片段插入pgadt7载体。

(6)2016年3月: 提取大肠杆菌的质粒进行pcr测序反应,得到靶基因序列,通过生物软件比对,对初步得到的结果做好统计。

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