1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
1.课题研究意义及应用前景
甲烷(ch4)作为一种信号分子,被证实能够提高内源no水平[1],一氧化氮(nitricoxide,no)是第一个被发现的参与体内信号转导的气体信号分子,no功能多样,调控方式可能是多靶点、多机制同时作用的网络调控。
亚硝基化(s-nitrosylation)是近年来新发现的一种不依赖于环磷酸鸟苷(cyclic guanosinc monophosphate,cgmp)的no信号传导途径, 即no可逆地共价结合到蛋白质半胱氨酸巯基(cys-sh)上形成亚硝基硫醇(rcys-sno)的过程。
2. 研究的基本内容和问题
1. 研究目标及内容
(1)通过切片检测验证不同处理下不定根原基的发生情况
(2)提取纯化总蛋白和亚硝基化蛋白,定量检测蛋白含量
3. 研究的方法与方案
1. 研究方法
1.1 实验材料
露丰黄瓜种子
1.2实验步骤
1.2.1植物材料准备
培苗:黄瓜种子使用5% 次氯酸钠消毒15 min后洗净,置于28 ℃培养箱中避光培养2天,挑选长势均一的种子光照培养5天,至叶片完全展开,根系生长良好。
去除植株中生长素:切除植株顶芽,置于10 μM萘基邻氨甲酰苯甲酸(NPA)中处理2天,耗尽植株中的生长素。
外植体制备:将处理后的植株切去初生根,用于接下来的处理。
1.2.2不同组合处理
预实验分为Non-depleted、Con、CH4、CH4 PTIO、CH4 SNP、PTIO、SNP七种处理,PTIO浓度和SNP浓度均为10 μM,后续实验增加浓度梯度。
1.2.3不定根原基切片检测
分别取不同处理的植株,使用甲苯胺蓝染色法,在显微镜下观察原基生长情况。
1.2.4蛋白质提取纯化
(1)称取0.2 g样品,液氮研磨,加入1.2 ml甲醇(提前加蛋白酶抑制剂PMSF1:100)
(2)置于-20 ℃中10 min,期间不断颠倒混匀(约3-4次)
(3)16000 r,4 ℃离心5 min,弃上清
(4)重复1-3步,直到颜色变乳白(约4-5次)
(5)加1.2 ml丙酮(-20℃预冷),涡旋,-20 ℃放置5 min
(6)16000 r,4 ℃离心5 min,弃上清
(7)重复5-6步,重复1-2次
(8)吹干至粉末(约30 min)
(9)加600 μl Type4溶解
1.2.5蛋白质含量测定(考马斯亮蓝法、Saville-Griess法)
总蛋白含量使用考马斯亮蓝法测定
亚硝基化蛋白含量使用Saville-Griess法测定
测定总蛋白含量:考马斯亮蓝法
(1)原理:考马斯亮蓝G-250(CoomassiebrilliantblueG-250)测定蛋白质含量属于染料结合法的一种。在游离状态下呈红色,最大光吸收在488 nm;当它与蛋白质结合后变为青色,蛋白质-色素结合物在595nm波长下有最大光吸收。其光吸收值与蛋白质含量成正比,因此可用于蛋白质的定量测定。蛋白质与考马斯亮蓝G-250结合在2 min左右的时间内达到平衡,完成反应十分迅速;其结合物在室温下1h内保持稳定。该法是1976年Bradford建立,试剂配制简单,操作简便快捷,反应非常灵敏,可测定微克级蛋白质含量,测定蛋白质浓度范围为0~1000 μg/mL,最小可测2.5 μg/mL蛋白质,是一种常用的微量蛋白质快速测定方法。
(2)试剂
考马斯亮蓝G-250染色液(1L):称取0.1 g考马斯亮蓝G-250溶解于50 ml 95%的乙醇中,加入100 ml 85%的磷酸。
标准蛋白质溶液:牛血清蛋白(BSA),准确称取0.1 g牛血清白蛋白,用100 ml 0.05M Tris-HCL缓冲液稀释,制成1mg/ml的标准蛋白质溶液,校准BSA浓度1mg/ml的A280为0.66。
需要250 ml 0.05M Tris-HCL缓冲液(PH8.0)(250ml):称取1.514 g tris碱,加入200 ml蒸馏水溶解,用盐酸调节PH至8,定容至250 ml
提取缓冲液:称取1.316 g Nacl,溶于150 ml Tris-HCL缓冲液中
(3)操作步骤
标准曲线绘制
| 管号 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| BSA体积(μl) | 0 | 20 | 40 | 60 | 80 | 100 |
| TRIS缓冲液体积(μl) | 100 | 80 | 60 | 40 | 20 | 0 |
| BSA含量(μg) | 0 | 20 | 40 | 60 | 80 | 100 |
| 每只试管加入3ml考马斯亮蓝,混匀静置5min,与595nm测定吸光度 | ||||||
| A595 |
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测定时用95%乙醇清洗比色皿
以A595nm为纵坐标,标准蛋白含量为横坐标,在坐标轴上绘制标准曲线。
样品中蛋白质含量测定
蛋白质含量测定:取0.1 ml上清,加入考马斯亮蓝3 ml,混匀静置5 min,于595 nm测定吸光度,根据标准曲线确定蛋白含量
样品的蛋白含量(μg/g)=m(μg)×提取液总体积/(所取提取液体积×样品鲜重)记录称取样品重量
测定S-亚硝基化蛋白含量:Saville-Griess法
(1)实验原理:SNO含量用Saville-Griess法检测:SNO被FeCl2破坏,释放的NO与对氨基苯磺酸反应,生成的重氮盐与芳香胺(N-(1-萘基)-乙二胺)结合生成偶氮染料,可以被540nm波长测定。
(2)试剂
100 μg/ml亚硝酸钠溶液:称取0.01g亚硝酸钠,稀释至100 ml。
1%对氨基苯磺酸溶液:1g对氨基苯磺酸溶于100ml蒸馏水
0.3% 盐酸萘乙二胺:称取0.3g盐酸萘乙二胺,蒸馏水定容至100ml,震荡摇匀,确保完全溶解
3.75mMFeCl2溶液:称取0.02gFeCl2溶于20ml蒸馏水中
(3)实验步骤
标准曲线制备:配置0.5ml标准浓度的亚硝酸钠溶液0-5 μg,加入HCL,1 ml 1%对氨基苯磺酸溶液,1 ml 0.3% N-萘乙二胺,100μl 3.75mM FeCl2室温保持30min后测定540nm处的光密度值,将此值与亚硝酸盐浓度进行直线回归,求回归方程和R值。
| 管号 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| 亚硝酸钠(100μg/ml)(μL) | 0 | 10 | 20 | 30 | 40 | 50 |
| 蒸馏水(μL) | 500 | 490 | 480 | 470 | 460 | 450 |
| 亚硝酸钠含量(μg) | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 |
| 加入1ml1%对氨基苯磺酸溶液,1 mL 0.3%盐酸萘乙二胺,100μl 3.75mM FeCl2反应30min | ||||||
| A540 |
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取0.5mL上清加入1 ml的1%对氨基苯磺酸和1 ml 0.3%盐酸萘乙二胺中,加入100μl 3.75mM Fecl2,冰浴黑暗条件下处理20min。不含FeCl2为对照。
SNO含量通过测定540nm处吸光度获得。然后在上述直线方程中获得SNO测定值。
2. 技术路线
3.可行性分析
本研究以陆丰黄瓜为材料,使用相关试剂处理,切片验证其对不定根生长的影响,通过蛋白提取纯化及蛋白定量检测等方法开展实验。实验室中上述材料及所涉及的相关试剂都较为齐全,已有的研究证实了此方法可靠,相关的仪器设备也较为完备。并且,课题选题恰当,难度适中,工作量适中,且能够取得较为明显直接的结果。
4. 研究创新点
选取与不定根中的蛋白,测定其亚硝基化水平,为下一步筛选出某种特定蛋白研究它们可能的酶、蛋白活性、稳定性打下基础,之后的研究可以检测特定蛋白的亚硝基化位点,研究不同位点亚硝基化对蛋白的影响。
5. 研究计划与进展
2019年3月:不定根原基数据完成、蛋白质分离纯化测定预实验
2019年4月:蛋白质定量测定
2019年4月-2019年5月:整理实验结果并撰写论文
