不同耐寒能力拟南芥种群HOS1、SIZ1基因表达量与其甲基化程度相关性分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1选题依据及研究意义 植物是地球生命的主要形态之一，与人类生命的延续和生活质量的提高息息相关。

低温是限制植物生长、发育、产量及地理分布的主要环境因子之一，也是植物生长发育中经常遇到的一种自然灾害，植物对这种伤害的适应性叫做耐冷性。

植物在不断地进化过程中形成了一套复杂但高效率的应答机制以抵御和适应低温胁迫。

2. 研究的基本内容和问题

1研究目标 1.1比较拟南芥不同耐冷种群siz1、hos1基因的表达量随时间变化的差异。

1.2探究siz1和hos1基因表达量与自身甲基化程度之间的关系，揭示受甲基化调节的基因转录动态规律。

2研究内容2.1根据拟南芥基因组及甲基化组测序数据，查找并比较典型耐冷性能力的拟南芥种群中cbf通路中siz1和hos1基因及启动子区域的基因及甲基化程度差异。

3. 研究的方法与方案

1研究方法1.1运用荧光定量pcr技术，选择典型种群，比较拟南芥不同耐冷种群siz1、hos1基因的表达量随时间变化的差异。

1.2结合先前实验室得到的不同拟南芥耐寒种群的基因甲基化程度信息，探究siz1和hos1基因表达量与自身甲基化程度之间的关系，揭示受甲基化调节的基因转录动态规律。

2技术路线（见附件）3实验方案3.1根据拟南芥基因组及甲基化组测序数据，查找并比较典型耐冷性能力的拟南芥种群中cbf通路中siz1和hos1基因及启动子区域的基因及甲基化程度差异。

4. 研究创新点

目前关于DNA甲基化的研究多集中在甲基化组学水平上，关于具体通路中特定基因通过甲基化调节表达的研究较少。

本课题就旨在探究SIZ1和HOS1基因表达量与自身甲基化程度之间的关系，揭示受甲基化调节的基因转录动态规律。

5. 研究计划与进展

2016年9月-2017年10月: 熟悉实验室环境，学习实验理论和实验技术。

2016年11月-2017年12月: 阅读文献，查找并比较典型耐冷性能力的拟南芥种群中cbf通路中siz1和hos1基因及启动子区域的基因及甲基化程度差异。

2017年1月-2017年4月: 开题报告撰写，实验进行：植株种植，寒冷处理，rna提取、反转录，qpcr。