以人的细胞系为模型分析miRNA表达量与转录的相关性开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1 国内外研究概况及研究意义

1.1 背景和国内外研究概况

1.1.1 microrna(mirna)简介

2. 研究的基本内容和问题

2 研究的目标、内容和拟解决的关键问题

2.1 研究目标

以人的细胞系为研究对象，运用生物信息学和统计学的方法，研究分析在基因组水平上转录活性和mirna表达量之间的相关性，藉此揭示新的基因调控机理。

3. 研究的方法与方案

3 研究方法、技术路线、实验方案及可行性分析

3.1 研究方法和实验方案

拟采取的研究方案，即是在ncbi（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）及encode（https://www.encodeproject.org/）网站上下载人的细胞系的mirna-seq、mrna-seq和chip-seq的数据集，然后利用数据分析网页平台galaxy（https://usegalaxy.org/）计算数据初步整理与合并，并用spss等数据处理软件分析转录活性和mirna表达量的相关性。最后，结合研究人的细胞系中的mirna表达，揭示调控机制的保守性、重要性。具体如下：

4. 研究创新点

基因组所有mirnas的表达量千差万别，是什么原因导致了该结果？鉴于转录是研究最多又是mirna形成的第一步，指导老师及其团队曾分析过在基因组水平上转录活性和mirna表达量之间的关系，发现在人的k562细胞系中相关系数仅为0.3，而在另一细胞系，hela，没有显著的相关性。

前人一直只是假设转录为mirna表达的决定性因素，此研究成果始料未及，该项目为指导老师的子课题，会更加深入和系统地研究在基因组水平上调控人的细胞系mirna表达的机制，系统考察转录对mirna差异性表达的影响，以揭示调控机制的保守性及重要性。

本项目将极大地巩固和发展现有成果，很大程度上拟补目前人类知识的明显空白。

5. 研究计划与进展