虎纹蛙(Hoplobatrachus chinensis Osbeck) 微卫星引物的筛选与扩增开题报告

 2021-08-09 00:52:34

1. 研究目的与意义

微卫星(microsatellite,ms) 是指核基因组中小于10 个核苷酸的简单重复序列,又称短串联重复(short tandem repeat,str) ,是一种普遍存在于人类及其他动物基因组的重复序列。

微卫星dna主要由核心序列和侧翼序列组成,其长度由重复单位的拷贝数决定。

由于微卫星dna标记具有数量多、在基因组内分布均匀、等显性遗传、多态性信息丰富、在不同基因位点上的微卫星 dna 的重复顺序可以不同也可以相同、具有遗传连锁不平衡现象、特异的pcr扩增、稳定性好、易于检测等特性,目前被广泛应用于生物遗传多样性研究、遗传结构分析、谱系和发育研究、品种鉴定以及个体间亲缘关系鉴定、基因流分析、种群结构、有效种群大小分析、种群动态分析、系统地理学、保护遗传学等各个领域。

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2. 国内外研究现状分析

当前在动物保护研究方面的趋势是将宏观与微观结合起来进行研究。

从分子水平开展虎纹蛙种群遗传结构研究对评价该物种以及其所占有分布领域的保护学价值,找出其中的进化显著单元,可以为更好地保护虎纹蛙资源提供理论依据。

微卫星位点左右的侧翼序列在近缘物种间是相对保守的,因而通过近缘物种跨种扩增以获得所需物种的微卫星序列被认为是可行的。

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3. 研究的基本内容与计划

一、研究内容1、根据植物myb转录因子基因dna结合域保守区,设计简并引物,以银杏为研究材料,扩增myb基因同源片段;2、以获得的myb基因的同源片段设计基因特异引物,通过race一pcr扩增myb基因的3端和5端cdna序列,进而扩增出目的基因的全长cdna序列;二、研究计划第一阶段:11.25--12.15:文献查阅与开题报告撰写。

第二阶段:2.21--2.30:准备实验材料,第三阶段:3.1--5.10:样本采集和dna 的提取,微卫星位点的选取,跨种pcr 扩增及检测第四阶段:5.11--5.31:整理实验数据,撰写毕业论文。

第五阶段:6.1--6.10:修改论文并准备答辩。

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4. 研究创新点

利用各地的虎纹蛙 进行更有效的对比试验

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