探究E3泛素连接酶CHIP对C型凝集素受体CLEC-2的调控开题报告

 2022-01-30 16:49:39

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

1.1 本课题的意义、研究概况及应用前景

c型凝集素样受体-2(clec-2)是一个非经典型的c型凝集素受体,主要表达在血小板、中性粒细胞等细胞表面。clec-2的转录体在外周血细胞、髓性细胞(单核细胞、树突状细胞和粒细胞)、自然杀伤细胞和肝有分布,但是目前流式细胞实验只检测到clec-2在血小板和巨核细胞表面表达。很多研究显示:clec-2在血小板活化聚集、肿瘤转移、血栓形成以及hiv在体内扩散中起着重要的作用。因此,clec-2可作为治疗相关疾病的靶蛋白,特异性的下调clec-2或者其下游信号,抑制血小板的活化,阻止肿瘤细胞逃逸。但还未有相关报道阐明这种特异性的靶点。

chip,即hsc70 c末端结合蛋白 (carboxy terminus of hsc70 interacting protein)是一个物种间氨基酸序列高度保守的胞浆蛋白,是一种e3泛素连接酶。该蛋白n端存在3个tpr(tetratricopepdide repeat)结构域,c端有1个u-box结构结构域,以及一个连接区域。chip通过它的tpr结构域与分子伴侣hsc70-hsp70 和hsp90结合,而u-box域含有e3泛素连接酶活性。chip在蛋白酶体和分子间起连接的功能,其与分子伴侣结合可导致相应靶蛋白的泛素化,从而促进多种蛋白底物被泛素-蛋白酶体系统降解和清除,参与细胞内蛋白质的质量控制,调节细胞的生理或病理过程,在心肌细胞损伤、细胞凋亡、肿瘤等方面有重要作用。chip能降解带有疾病信号的蛋白,比如乳腺癌和卵巢癌中的erbb2可能起干预治疗的作用。所以,chip有可能作为一种药物,指向性的使与之结合的蛋白降解,从而阻断该蛋白的下游信号通路,阻止其相应功能的发挥。

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2. 研究的基本内容和问题

2.1 研究目标

1)研究chip是否下调clec-2含量。

2)研究chip与clec-2是否存在相互作用。

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3. 研究的方法与方案

3.1研究方法

1)分子克隆构建表达CHIP-Flag质粒。

2)在293T细胞中共同转染CLEC2-myc和不同浓度的CHIP,通过免疫印迹western blot检测CLEC2-myc的表达。

3)通过免疫共沉淀实验、激光共聚焦实验确定CHIP与CLEC-2存在相互作用。

3.2技术路线

构建质粒以及培养293t细胞→转染293t细胞(CHIP、CLEC-2)→①

提取蛋白,通过western blot检测蛋白表达;②提取蛋白,通过免疫共沉淀 CHIP与CLEC-2是否存在相互作用;③通过激光共聚焦实验进一步确定CHIP和CLEC-2存在相互作用

3.3实验方案

3.3.1分子克隆

1)PCR反应获得CHIP的基因序列。

2)限制性内切酶酶切反应。

3)用胶回收试剂盒回收DNA片段。

4)将片段和载体用DNA连接酶在4℃连接过夜,约16h。

5)制备大肠杆菌E.coli感受态细胞。

6)转化E.coli感受态细胞(CaCl2 方法)

7)挑取4个生长在含有Amp的LB固体培养板上的单克隆菌落,接种于3ml含Amp的LB培养基中,37℃恒温,振荡培养过夜,用碱裂解法少量制备细菌质粒DNA。酶切鉴定含有阳性片段的质粒DNA,将相应的E.coli细胞保种,保存于-20℃。

8)用质粒抽提试剂盒制备用于转染的质粒DNA。

3.3.2浓度梯度转染试验

1)细胞培养:所用细胞293t为实验室冻存的细胞系,经过复苏、培养、传代。

2)转染:传代后,待细胞长到对数期,约70-80%,CHIP-Flag与CLEC2-myc质粒以合适比例共同转染293t细胞,26h给细胞加入DMSO或MG132,继续培养4h后收集细胞。

3)提蛋白:收集细胞离心后去上清,酌量加入裂解液,在冰上裂解30分钟后加5xloading buffer,沸水煮10分钟。

4)western blot检测蛋白表达。

1

2

3

4

CLEC-2-myc-his

CHIP-FLAG

MG132

3.3.3免疫共沉淀试验(IP)

1)将CHIP与CLEC-2质粒转染入293t中,转染后26h给细胞加入DMSO或MG132,继续培养4h,收细胞,用1xIP裂解液裂解细胞,在4℃冰箱中轮转2h。

2)用预冷的PBS洗珠子,将珠子在4℃冰箱中轮转10分钟,重复三次

3)将裂解的细胞离心后去上清,一部分直接加入loading buffer沸水煮10min后保存。

4)将剩余上清加入抗体在冰箱4℃轮转孵育1h,然后加入洗好的珠子结合,再用预冷的PBS洗三次,加入loading buffer沸水煮10分钟。

5)通过western blot检测蛋白表达及相互作用。

3.3.4荧光共聚焦显微镜观察(confocal)

1)培养细胞:将Hela细胞传代培养至细胞对数生长期,消化细胞。

2)制片:将细胞接种到放置有处理过的盖玻片的培养皿中,孵育。

4) 转染:CHIP-Flag与CLEC2-myc质粒以1:1比例共同转染细胞。

5) 培养28小时后,固定、透化细胞,分别用Flag和myc的一抗及荧光抗体孵育。

6) 封片,并使用带有荧光素滤光片的共聚焦显微镜观察细胞。

3.4可行性分析

本人所在实验室为卫生部糖复合物重点实验室,实验室多年来从事糖复合物结构与功能研究,实验室的前期研究中已经探究了RACK1等分子对CLEC-2的调控作用。这些研究结果不仅为本项目的研究背景奠定了重要基础,同时为今后进一步探究CLEC-2降解机制,进而揭示肿瘤逃逸的分子机制积累了资料,具有十分重要理论意义。

另外本实验室条件充裕,在细胞培养、转染,DNA、RNA提取等方面都技术成熟,具备此次实验所需的各种器材、试剂。本研究所涉及的背景知识我已经熟悉,对本研究所需的实验设备,我已经掌握了操作技术。

4. 研究创新点

CLEC-2作为一种新发现的C型凝集素受体在血小板聚集、肿瘤转移等生理过程中有着重要作用,是研究血小板相关疾病的要分子,目前已有RACK1等分子对CLEC-2的作用研究,但泛素连接酶CHIP与CLEC-2相互作用的机制与功能鲜有报道。本实验通过研究泛素连接酶CHIP调节C型凝集素受体CLEC-2信号的机制和功能以期对癌症治疗中抑制肿瘤转移有借鉴作用。

5. 研究计划与进展

2014年2月到3月 查阅文献,了解熟悉试验流程,掌握试验重要环节和关键步骤并进行预实验

2014年3月到5月 撰写开题报告,完成全部实验,记录与处理实验结果与数据

2014年5月到6月 撰写毕业论文并准备答辩

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