黄酮类化合物与血清蛋白的分子对接研究开题报告

1. 研究目的与意义

黄酮类化合物（flavonoids）是一类存在于自然界的且具有2-苯基色原酮（flavone）结构的多酚类化合物。黄酮类化合物具有药用价值，用于防治心脑血管疾病，如能降低血管的脆性、改善血管的通透性、降低血脂和胆固醇，防治老年高血压、脑溢血、冠心病、心绞痛、扩张冠状血管，增加冠脉流量。许多黄酮类成分具有止咳、祛痰、平喘及抗菌的活性，同时具有护肝、解肝毒、抗真菌、治疗急、慢性肝炎、肝硬化及抗自由基和抗氧化作用。血清白蛋白是人体血浆中含量最丰富的蛋白，也是负责运输各种外源性、内源性小分子的主要蛋白质之一，这些小分子只有通过与血清白蛋白发生可逆的非共价结合后，才能被转运至相应的靶部位发挥作用。

研究黄酮类化合物（黄芩素、黄芩苷、槲皮素、芦丁、大豆素、葛根素）与血清白蛋白的结合，对于研究药物代谢动力学、生物化学、制药学和临床医学具有重要的参考价值。

黄芩素具有降低脑血管阻力，改善脑血循环、增加脑血流量及抗血小板凝集的作用。临床用于脑血管病后瘫痪的治疗。黄芩素是体内的有效成分，黄芩素进入动物体内后，在血液中迅速转化为黄芩苷及其他代谢物。而黄芩苷具有显著的生物活性，具有抑菌、利尿、抗炎、降胆固醇、抗血栓形成、缓解哮喘 、泻火解毒、止血、安胎、抗变态反应及解痉作用，也为哺乳动物肝脏涎酶的特异性抑制剂，具有调节某些疾病的作用，也具有较强的抗癌反应生理效能。

2. 研究内容和预期目标

研究内容：在查阅黄酮类化合物相关文献报道的基础上，通过计算机模拟技术，对黄酮类化合物与血清白蛋白的相互作用进行研究。具体内容包括：

（1）查阅并综述黄酮类化合物在各疾病领域的研究进展及作用机制；

（2）熟悉计算机模拟技术在药物研发领域的应用情况，综述基于受体三维结构的分子对接技术（molecular docking）在研究药物作用机理方面的进展，并设计出黄酮类化合物与血清白蛋白相互作用的受体-配体结合研究方案；

3. 研究的方法与步骤

利用分子对接技术计算出与黄酮类物质结合的血清蛋白的分子靶点。

结构预处理：应用chemdraw 软件画出黄酮类物质的分子结构，在蛋白质 pdb 晶体结构数据库(http://www.pdb.org)中找寻找血清蛋白受体的结构；对接模拟前，将所有配体从蛋白受体复合物中去除，此时加上极性氢离子及电荷。最后与黄酮类物质进行分子对接。

autodock分子对接：运用 autodock 4.2预测黄酮类物质与血清蛋白受体的结合，用 autogrid 计算格点能量，对接运算采用拉马克遗传算法，黄酮类物质与血清蛋白受体之间的结合情况用半经验的自由能计算方法评价。

4. 参考文献

5. 计划与进度安排

（1）2022-12-23~2022-3-15（第1-3周）在查阅文献资料的基础上，写出开题报告。

（2）2022-3-16~2022-5-31（第4-14周）完成黄酮类化合物与血清蛋白的分子对接研究并推测其结合位点及氨基酸残基等。

（3）2022-6-1~2022-6-12（第15-16周）撰写毕业论文并答辩。