高表达基因Per2对卵巢癌抑制作用的的生物信息学分析开题报告

 2021-08-08 10:44:16

1. 研究目的与意义

生物钟基因作为内源性节率起步器使生物机体的生命活动维持大约以24小时为周期的近日节律以适应外界环境的变化,从而维持机体的内稳定。

生物节律的紊乱会导致一系列疾病甚至癌症。

大量研究表明核心生物钟基因per2与癌症发生发展关系密切,是一种抑癌基因,其作用机制可能与per2基因与雌激素受体α生物节律的信号传导、调节细胞周期诱导凋亡、肿瘤抑制蛋白有关,且研究发现,per2甲基化与乳腺癌的发生高度相关,这可能是节律紊乱容易导致乳腺癌发生的重要因素。

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2. 国内外研究现状分析

1:Konopka在1971年首次研究了生物钟基因的突变对生物行为的影响,她通过诱导果蝇精子中NDA的随机突变来观察其突变子代的羽化时间,结果发现第一种突变体节律失调(称为0或者节律失调型),它会在白天或黑夜的任何时间羽化,接着他又分离出两种突变体,其中一个羽化得早(在黎明之前,称为S型),另一个羽化的晚(在 黎明之后,称之为L型),而正常果蝇的自由运转节律周期稍长于24h。将这些果蝇和野生果蝇杂交后发现,与果蝇生物钟的行为变化相连的突变源于单基因。因为这个基因的突变改变了果蝇的昼夜节律周期,因此它被称为周期 基因(period),在小鼠和人体内也发现类似于果蝇Period基因,二者均含有保守的PAS结构域文献来自于《生物钟Per3基因多态性与乳腺癌易感性的相关性研究》:

2:宁夏大学为了研究per1和per2之间的关系,采用试验方法进行细胞株的培养,PMA诱导细胞产生生物钟基因的表达。取不同时间点的细胞,采用免疫组织化学法和RT-PCR检测体外培养的胶质瘤细胞和正常细胞的Per1、Per2基因表达的差异。 结果对免疫细胞化学结果用Image pro-Plus进行处理,方差分析结果显示PMA刺激诱导的NIH3T3细胞中Per1、Per2基因的表达表现为近日节律,而PMA刺激诱导的C6细胞中Per1、Per2基因的表达不表现为近日节律,NIH3T3细胞中Per1、Per2基因的表达与C6细胞中Per1、Per2基因的表达有显著性差异。采用RT-PCR半定量检测NIH3T3细胞与C6细胞中Per1、Per2基因的mRNA,实验结果处理得出了同样的结果。 结论C6细胞和NIH3T3细胞内均存在Per1和Per2基因的表达。Per1和Per2基因在NIH3T3细胞内呈近日节律性表达,而在C6细胞内Per1和Per2基因的表达不表现为近日节律且表达水平较低。文献来源《per1per2在体外培养的胶质瘤细胞和正常细胞中的表达的差异性研究》

3. 研究的基本内容与计划

内容:生物钟的工作机理以及和卵巢癌的关系,阐明生物钟对卵巢癌的抑制原理。

计划: 1,前三周时间主要用来研究课题,作深入的了解,清楚生物钟和卵巢癌的具体内在关系。 2,接下来五到七周的时间用来资料的收集和整理,主要途径是图书馆的图书借阅,老师的定向咨询。 3,接下来大概五周的时间,主要进行设计所需要的实验等等,做好实验记录,数据分析等等,为下面的设计做好铺垫。 4,最后几周,主要填写毕业设计,尽量完善所写的数据和资料,发现不会的地方及时的请教老师和成绩好的同学,尽量做到完美设计。

4. 研究创新点

色与创新:1,多角度的分析方法分析了生物钟与卵巢癌的密切关系,更具说服力; 2,引进国外先进的技术分析结果,并结合了国内的研究成果,双向分析; 3,采用实验数据分析法,所得的大多数据都是实验总结出来的,比较科学。

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