1. 研究目的与意义(文献综述)
蛋白质关系抽取是生物医学信息抽取领域的重要分支。研究蛋白质相互作用关系,对于探究生物进程存在的分子体制、分析机体细胞的生命活动具有重要的基础研究意义,进而用以分析疾病的起因,提出针对性的预防和治疗手段。因此如何高效而又准确地从生物医学文本中抽取蛋白质关系(Protein-Protein Interaction , PPI)成为医学领域文本挖掘的主要任务之一,具有重要的研究意义。
2. 研究的基本内容与方案
了解关系抽取基本流程;
. 掌握蛋白质-蛋白质关系抽取模型的实现方法;
. 对以下多种实现方式进行比较实验:
3. 研究计划与安排
第一周、二周:通过知网,google学术等工具了解抽取的基本流程
第三周、四周:通过学习github上相应的python代码,了解蛋白质-蛋白质关系抽取模型的基本实现方法
4. 参考文献(12篇以上)
[1]李丽双,刘洋,黄德根.基于组合核的蛋白质交互关系抽取[j].中文信息学报,2013,27(1):86-93
[2]li l, zhang p, zeng t, et al . intergrating semantic information into multiple kernels for protein-protein interaction extraction from biomedical literatures[j] plos one ,2014, 9(3):28-47
[3]jiang z, li l, huang d, et al. training word embeddings for deep learning in biomedical text mining tasks[c]//proceeding of 2015 ieee international conference on bioinformatics and biomedicine.2015: 625-628.
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