mRNA可变剪切在肝癌中的作用的统计研究开题报告

全文总字数：4527字

1. 研究目的与意义（文献综述）

(1)研究目的

原发性肝癌是临床上常见的消化系统恶性肿瘤之一，其中包括有肝细胞癌、胆管细胞癌等不同病理类型。在世界范围内，原发性肝癌是男性常见五大癌症之一，同时也是女性第七大常见癌症。我国的原发性肝癌新发患者约占全球55%，其中有90%以上是肝细胞癌。原发性肝癌的患病率逐年增加，严重影响患者生活质量，增加家庭及社会经济负担。如何减轻原发性肝癌患者痛苦、提高其生活质量、延长生存期及中西医结合治疗方案等方面的研究已是当今原发性肝癌的热点问题。

可变剪切(alternative splicing, as)又称选择性剪切，在mrna前体到成熟mrna的过程中由于剪切方式不同导致一个基因可以产生多个不同的成熟mrna，进而产生不同蛋白质。近年来，越来越多的证据表明mrna可变剪切事件与肿瘤的产生、发展显著相关，并参与了癌细胞的侵袭转移过程。研究mrna可变剪切对于肝癌的诊断和治疗，以及预后至关重要。因此，我们的研究目的是找出肝癌样本与正常样本中有显著差异的可变剪切事件，由此加深对肝癌在基因层次的理解，并为肝癌的靶向治疗、药物的筛选以及今后肝癌的预防等提供新的方向。

2. 研究的基本内容与方案

(1)研究的基本内容

本文的主要研究对象为不同基因在不同位置发生的可变剪切事件(共4142个)的拼接百分比(psi值)，样本取自371名肝癌病人和50名正常个体。基本内容包括对mrna可变剪切的生物学理解和与肝癌的相互关系，异常发生的可变剪切事件如何引发肝细胞癌变以及如何通过样本可变剪切的psi值判别是否为肝癌样本。

(2)研究目标

3. 研究计划与安排

第1－3周：查阅有关mrna可变剪切的文献资料，明确研究的主要内容。翻译相关的英文文献，撰写毕业论文开题报告。结合指导老师的意见认真改正自己的不足之处。

第4－5周：了解并学习拟采用的模型和算法。完成数据的预处理和特征筛选工作。

第6－8周：利用筛选得到的特征数据构建分类器模型，计算分类的准确率。并根据准确率对原模型进行改进和调整。完成毕业设计（论文）中期进展情况检查表。

4. 参考文献（12篇以上）

[1] 李运明.基于sam的基因表达谱数据分析方法研究及应用[d].西安:第四军医大学, 2008.

[2] 李运明,曹文君,陈长生.六种基因表达谱数据筛选差异表达基因方法的比较[j].中国卫生统计, 2009, 26(3)：250-254.

[3] manfredi e r m. biomarkers discovery through multivariatestatistical methods: a review of recently developed methods and applications inproteomics[j]. journal of proteomics bioinformatics, 2015, s3.