闽楠SSR引物筛选及群体检测开题报告

1. 研究目的与意义

闽楠是我国著名的珍稀用材和国家二级重点保护树种，开展闽楠遗传多样性等方面的研究将为浙江楠的保护和利用提供依据，SSR标记是研究遗传多样性比较理想的标记。

本研究将利用闽楠转录组测序数据，开发一批多态性高、稳定性强的SSR标记，并进行群体检测，为闽楠的遗传多样性分析提供高效工具。

2. 国内外研究现状分析

闽楠是我国特有的亚热带地区优秀乡土树种，其天然分布区为长江流域以南各省区，但由于长期对该树种资源的不合理开发利用，闽楠的天然资源已经逐渐枯竭,现已成为国家二级珍稀濒危植物，仅见于闽、赣、鄂西、湘东、浙南等山地常绿阔叶林中,在海拔100m1000m左右范围内呈聚集状零星垂直分布。

然而国内外现有的对闽楠的研究大多集中在对闽楠的遗传学方面研究并不普及[1]，使得缺乏相应的用于闽楠的保护策略制定的理论指导。

因此对于闽楠遗传学特性的研究亟待开展。

3. 研究的基本内容与计划

方案拟定 基于现有闽楠转录组数据寻找ssr位点设计引物，构建闽楠ssr分子标记体系，利用多个闽楠个体筛选、开发ssr标记，进行群体检测。

实验技术路线1.样品收集2.dna提取及质量检测3.est-ssr位点确定4.ssr引物设计5.ssr-pcr引物扩增6.多态性引物筛选7.ssr闽楠群体检测8.结果判读和数据处理实验数据处理1 利用pimer5.0软件设计引物，优化构建闽楠ssr标记体系。

2.在不同群体中选6个个体进行多态性标记选择；3.利用多态性ssr标记对来自江西、福建等地闽楠进行群体检测；4.对实验结果进行统计和分析。

4. 研究创新点

项目创新特色概述1.基于现有闽楠转录组数据寻找ssr位点设计引物，构建闽楠ssr分子标记体系。

2.利用多个闽楠个体筛选、开发ssr标记，进行群体检测。

为闽楠的遗传多样性分析提供高效工具。