喜树ISSR分子标记开发与喜树遗传多样性分析开题报告

1. 研究目的与意义

国内关于喜树的研究尚且处于起步阶段，喜树面临着亲本遗传基础狭窄的育种困境，喜树的遗传多样性的相关研究甚少。

本研究通过运用群体遗传学原理，优化并建立喜树issr-pcr反应体系，开展喜树遗传多样性分析，从分子标记方面，对喜树的遗传变异及遗传结构等进行了探讨。

通过对喜树资源遗传多样性研究, 可有效减少相似遗传背景的组合, 减轻育种的工作量, 对于亲本的杂交组合配置具有重要的指导意义。

2. 国内外研究现状分析

喜树的研究主要集中在栽培技术、生长发育规律、喜树碱产量和定位等方面，以及对喜树种子的研究主要集中在喜树种子的萌发和喜树碱含量的变化方面（谢慧敏等，2017）。

喜树中含有生物碱、黄酮、鞣花酸衍生物、有机酸和苷类等多种化学成分。

美国科学家monore e. wall从喜树的皮中分离出喜树碱，经肿瘤试验证明其具有抗癌活性，从而引起了人们的广泛关注（杨雪艳，2017）。

3. 研究的基本内容与计划

issr分子标记具有多态性高，广泛分布于基因组中等有点。

基于生物信息学的方法，运用喜树的转录组数据开发设计喜树的issr引物，并筛选出稳定性好、多态性高、具有较高重复性的引物。

基于本课题组从江苏、贵州、云南、湖北、广东等主要分布地区的收集15份喜树种质资源，运用所开发设计的issr引物进行遗传多样性分析，初步对我国喜树种质资源进行分子评价。

4. 研究创新点

1.喜树尚无合适的分子标记，本研究通过喜树转录组数据，运用生物信息学分析方法，设计和开发适合喜树遗传多样性分析的ISSR分子标记。

2.喜树的种质资源遗传多样性一直缺乏相关研究，本研究通过在全国范围类收集的代表性喜树种质资源，通过分子标记方法评价现有喜树种质资源的遗传多样性，为喜树的分子育种奠定基础。