鹅掌楸LcTCP基因克隆及生物信息学预测开题报告

1. 研究目的与意义

tcp基因编码植物特异性的转录因子，含有一个bhlh motif，能够与dna 结合或者产生蛋白质与蛋白质的互作。

tcp 基因家族在单子叶植物中有5个成员，在双子叶植物中有超过20个成员。

基因的复制和多样化进化出了两类有轻微不同tcp domain 的tcp基因家族。

2. 国内外研究现状分析

从1999年，p.cubas 等 第一次提出tcp基因家族概念，其编码的蛋白具有保守的tcp结构域，参与调控植物生长发育过程，是一类植物特有的转录因子家族。

目前，关于植物tcp类转录因子与其他蛋白互作方面的研究已更深一步，tcp蛋白与其他蛋白的相互作用通过tcpdomain来实现。

tcp蛋白之间可以形成同源和异源二聚体，不同的异聚化组合具有不同的亲和力，可以结合不同的dna元件，可能在特定生物学过程中发挥作用。

3. 研究的基本内容与计划

3 研究内容及计划：研究内容：（1）lctcp基因est序列筛选及中间片段的克隆；（2）采用race技术对cdna末端快速扩增及全长拼接；（3）lctcp基因编码蛋白质序列、结构以及理化性质等生物信息学预测。

研究计划：（1）准备工作阶段2017年.12月1日-2018年1月20日：阅读相关资料，了解研究课题的相关基本知识；（2）分析研究阶段2018年2月25日-2018年3月25日：结合自己所掌握的知识，以及实际的数据，实验结果，对比国外及国内的相关行业，得出优点及不足，提出自己的关于tcp基因在鹅掌楸叶片生长发育的作用。

（3）撰写毕业论文阶段2018年3月25日-2018年4月25日：根据笔记和手稿整理并撰写论文；（4）交审毕业论文阶段2018年4月25日：答辩阶段：交论文，审核，准备答辩。

4. 研究创新点

我们在研究tcp基因的过程中，是选择了est片段，并且采用较为先进了race技术对此进行克隆，同时我们在了解鹅掌楸的生物学信息，对其效果进行预测及验证，也为tcp基因在鹅掌楸在叶片发育中所起到的调控作用奠定了基础。

也是目前该领域的一个空白项目，通过这次科研项目，可以获得更多有关于tcp基因的真相。

race技术称为cdna末端快速扩增技术，是一种快速克隆目的mrna 3或5末端以获得全长mrna的分子生物学技术[l]。