高分辨率溶解曲线在樟树SNP检测中的应用开题报告

1. 研究目的与意义

樟树是天然香料树种之一，可以提炼精油，是我国重要的经济树种，依据叶精油中主要成分的种类和含量,可将樟树划分为脑樟、芳樟、油樟、异樟、龙脑樟5种化学类型。

其中较为重要的桉叶油素、芳樟醇、樟脑广泛用于食品、医药、日用化工等部门，尤其随着社会经济的发展，这些叶油的需求量正在逐渐增加。

在樟树资源分布区内，各种生化类型的樟树混生在一起，难以辨认和区分，获得的成分也十分混杂，因而其经济价值大幅度降低。

2. 国内外研究现状分析

snp作为第三代遗传标记被国内外越来越广泛的应用于疾病遗传学、药物基因组学及生物多样性分析中。

目前snp的高通量检测方法主要有直接测序、dna芯片、变性高效液相色谱(dhplc)、质谱检测技术、高分辨率溶解曲线(hrm)等其中高分辨率溶解曲线分型法，通过实时监测pcr扩增产物的响熔解曲线的峰形，能够有效区分不同snp位点与不同基因型。

该方法性价比高，重复性强，在医学领域广泛应用，目前在植物领域应用较少，樟树的snp研究未见报道。

3. 研究的基本内容与计划

研究内容:1.了解樟树基于精油的含量和生化特性的5种分类类型；2.了解高分辨率熔解曲线SNP分型的技术原理和基本应用；3.学习掌握高分辨率熔解曲线SNP分型的体系建立、优化与评估方法；具体时间安排：2016年12月2017年2月：准备阶段；查阅相关文献，了解樟树的生物学特性和SNP分型的基本原理；2017年3月5月：转录组预测的SNP数据分析，筛选候选的分型位点；建立优化高效的高分辨率熔解曲线SNP分型体系；SNP分型体系的效率评估。

2017年6月上旬：撰写论文，准备答辩。

4. 研究创新点

利用高分辨率熔解曲线技术进行SNP分型在植物研究中的应用相对较少，在樟树的基因分型研究中未见报道，建立樟树的高分辨率溶解曲线SNP分型体系，作为SNP快速鉴定、鉴定、基因分型技术基础。