杨-桤混交林4种土壤微生物总DNA提取方法的比较开题报告

 2021-08-08 21:50:09

1. 研究目的与意义

研究目的:通过对4种土壤微生物总dna提取方法(2种试剂盒法和2种手工提取法)的比较,对其提取效率和dna纯度进行比较,并进行后续的pcr扩增,为该林地土壤微生物多样性的分析选择一种最为合适的dna提取方法。

研究意义:土壤微生物是森林土壤生态系统中重要的消费者和分解者,生态系统内动、植物和微生物的残体需要通过微生物的分解作用转化为简单的小分子养分,从而供给林木吸收利用。

研究土壤微生物的多样性,对于阐明林地土壤的养分周转及其对林木养分吸收和生长的反馈起着非常关键的作用。

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2. 国内外研究现状分析

文献综述附后

3. 研究的基本内容与计划

本课题以杨树桤木混交林林地土壤为研究对象,拟采用4种不同的土壤dna提取方法(2种试剂盒法和2种手工提取法)提取土壤微生物dna,对其提取效率和dna纯度进行比较,并进行后续的pcr扩增,为该林地土壤微生物多样性的分析选择一种最为合适的dna提取方法。

研究内容主要包括:(1)采用不同提取方法对杨桤混交林土壤微生物dna进行提取和纯化;(2)dna提取浓度和纯度的比较;(3)不同方法提取的dna琼脂糖凝胶电泳及结果分析;(4)不同提取方法所得dna的pcr扩增及16s dna电泳图谱分析。

试验预期进展:2016年1月~2016年2月 收集和阅读相关文献,撰写开题报告;2016年3月~2016年4月 土壤样品采集及微生物总dna提取、电泳分析;2016年5月试验数据处理分析,论文撰写;2016年6月毕业论文答辩。

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4. 研究创新点

基于土壤微生物宏基因组的现代分子生物学技术目前在土壤微生物多样性分析分析得到广泛的应用,主要方法包括PCR-DGGE、克隆文库法、限制性酶切片段长度多态性法、以及全基因组测序等。

而所有这些方法的关键前提步骤都是高质量的土壤微生物宏基因组DNA的提取,本论文通过对不同方法提取得到的DNA的浓度和纯度、琼脂糖凝胶电泳图谱、PCR扩增电泳图谱等结果进行合理的分析,概括、精确地总结杨桤混交林土壤不同微生物总DNA提取方法的优、缺点,同时与相关研究结果进行比较和讨论,以得到的结论为基础,最终提出适用于该土壤、能够合理评价土壤微生物多样性的DNA提取方法。

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