樟疫霉部分RXLR-DEER效应蛋白的筛选及其表达规律研究开题报告

1. 研究目的与意义

樟疫霉（phytophthora cinnamomi）属于卵菌门疫霉属（phytophthora），广泛分布于欧洲、美洲、东亚、南亚及大洋洲等地区，其寄主广泛，包括樟属植物在内的超过3000多种林木和农作物等。

由该菌侵染樟属植物引起根部腐烂以及枝干溃疡等病害，对樟属植物造成毁灭性的破坏。

樟疫霉已经成为林木病害防治的重要病原菌之一，据报道，该菌已造成澳大利亚西南地区森林结构和植物种群的变化，已经成为影响当地自然生态系统以及生物多样性的重要威胁之一。

2. 国内外研究现状分析

目前，对引起樟属植物疫霉病害的樟疫霉的研究，尚未在其寄主上建立直接的互作研究体系。

对植物与病原菌互作关系方面的研究，国内外众多学者多采用拟南芥作为模式植物代替其原有病原菌寄主。

这是由于拟南芥具有较小的二倍体基因组、相对容易的转化方法、较多的突变体等优点，然而，在试图建立樟疫霉与拟南芥的互作系统研究中，发现尽管不同生态型的拟南芥离体叶片可以表现出对樟疫霉的敏感性，但叶部的病害症状一般不明显。

3. 研究的基本内容与计划

内容：卵菌基因组存在一类特殊的分泌蛋白，它们是从已鉴定的无毒基因的序列比对中被发现：一般为短蛋白，没有内含子，序列前端的信号肽下游，50-70 位氨基酸左右，具有保守的 rxlr-deer 元件。

rxlr类（r，精氨酸；x，任何氨基酸；l，亮氨酸）效应分子在卵菌逃避植物识别以及卵菌进化过程中均起着重要作用。

前期的研究借助重复比对（recursive blast）、隐马尔可夫（hmm）、跨膜结构预测等生物信息学方法，从樟疫霉中筛选出266个rxlr类类效应分子，并对这些效应分子的进化关系和结构域进行分析。

4. 研究创新点

1、选用本氏烟草作为模式作物。

2、以小鼠细胞凋亡蛋白诱导因子Bax为激发子，采用双元病毒表达载体 （PVX）。