入侵植物北美车前的微卫星（SSR）引物开发及遗传多样性评估开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

植物入侵已经对生态系统和社会经济造成巨大的危害,然而人们对其入侵机制的了解还没有统一的认识。本研究中的研究对象北美车前是一种原产自美国，入侵中国的一年生或越年生杂草，属果园、旱田及草坪杂草。其种子多，繁殖能力极强，蔓延迅速，长入侵和危害草坪，并且当种群密度大，花粉数量较多时，可能会导致花粉过敏症。北美车前目前已在中国浙江、上海、江苏、安徽、江西、福建、台湾、广东、湖南、四川、河北等地广泛分布，危害严重。

分子标记是以生物大分子的多态性为基础的一种遗传标记。dna分子标记与其他遗传标记相比具有许多明显的优越性，并已广泛应用于植物遗传多样性分析与种质鉴定等工作中，具有广阔的应用前景。其中本实验所采用的ssr标记，又称为简单重复序列，是一类由几个(多为1~6个)碱基组成的基序串联重复而成的dna序列，其长度一般较短。ssr的产生实在dna复制或修复过程中dna滑动和错配或者有丝分裂、减数分裂期姐妹染色单体不均等交换的结果。微卫星主要以两个核苷酸为重复单元。尽管微卫dna分布于整个基因组的不同位置，但其两端序列多是保守的单拷贝序列，因此可以根据这两段的序列设计一堆特异引物，通过pcr技术将其间的核心微卫星dna扩增出来，利用电泳分析技术就可获得其长度多态性，即ssr标记。ssr标记因具有共显性、高度重复性、高度丰富的多态性等优点，成为构建遗传连锁图谱、遗传多样性等研究的理想工具。

本研究通过利用自己开发的分子标记引物对北美车前的遗传多样性的变化进行深入研究，并和原产地种群进行比较。其结果将会有助于我们进一步了解植物入侵的潜在机制，并对其危害的控制提供理论依据。

2. 研究的基本内容和问题

植物入侵的过程中必然经历了遗传的瓶颈。

由于小种群中，个体的异交几率变小，适应自交的物种或种群将有较大的几率在新环境中建植成功。

最终，能够适应自交或者说能够去除导致自交衰退等有害等位基因的基因型会被选择下来，并获得较高的适合度。

3. 研究的方法与方案

1、引物设计

利用磁珠富集法，通过建立和筛选微卫星富集文库进行引物开发。

2、pcr反应

4. 研究创新点

北美车前虽然在中国广泛分布，但对其遗传多样新的变化的研究相对较少，且应用SSR标记技术对其进行的研究也相对较少。

虽然植物入侵对生态系统的造成的危害已被广泛认识，然而人没对齐侵入机制的了解还没有统一的认识，本研究的结果将有助于我们进一步了解植物入侵的潜在机制，并对其危害控制提供理论依据。

5. 研究计划与进展

1、2013年10月-2013年12月，进行引物的开发与筛选。

2、2013年12月-2014年1月，将分离结果进行统计分析，对其遗传多样性的变化进行研究分析，并与原产地种群进行比较。