玉米dirigent基因家族的生物信息学分析任务书

 2022-11-15 10:04:43

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1. 掌握植物基因家族成员的鉴定、染色体分布和复制事件、系统发育、基因结构和保守基序、基因表达分析等方法。

2. 鉴定出玉米基因组中的dirigent基因,获取其基本信息,明确其进化历史与机制、基因表达模式、蛋白质互作情况等。

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2. 实验内容和要求

1.玉米中dirigent基因的系统鉴定。通过blast比对、pfam蛋白质结构域鉴定等手段筛选出玉米中dirigent基因家族所有成员。

2. 基因复制和系统发育分析。通过分析dirigent基因的复制事件和系统发育关系,明确该家族的进化历史与机制。

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3. 参考文献

[1] liao y, liu s, jiang y, et al. genome-wide analysis and environmental response profiling of dirigent family genes in rice (oryza sativa) [j]. gen. genom., 2017, 39(1):47-62.

[2]guo j l, xu l p, fang j p, et al. a novel dirigent protein gene with highly stem-specific expression from sugarcane, response to drought, salt and oxidative stresses[j]. plant cell rep., 2012,31(10):1801-1812.

[3] 穰中文, 周清明. 水稻dirigent基因家族生物信息学分析[j]. 湖南农业大学学报(自然科学版), 2013, 39(02):111-120.

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4. 毕业设计(论文)计划

2022年11月-2022年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件;

2022年1月-2022年3月,完善技术路线,开展各种分析;

2022年4月-2022年5月,分析和整理实验结果,撰写论文。

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