玉米C3HC4环指蛋白家族的生物信息学分析任务书

1. 毕业设计（论文）的内容和要求

2. 鉴定出玉米基因组中的c3hc4环指蛋白基因，明确其进化历史与机制、基因表达模式、蛋白质互作情况等。

2. 实验内容和要求

1.玉米c3hc4基因家族成员的鉴定。通过关键词搜索、blast比对等手段鉴定出玉米中c3hc4家族所有成员；

2.基因复制和系统发育分析。通过分析c3hc4基因的复制事件和系统发育关系，明确该家族的进化历史与机制；

3.基因表达分析。通过检索ncbi est数据库获得基因表达信息，明确玉米c3hc4基因在不同组织器官中的表达情况。

3. 参考文献

[1] stone s l,hauksdo′ttir h, troy a, et al.functional analysis of the ring-type ubiquitin ligasefamily of arabidopsis[j]. plant physiol., 2005, 137(1):13–30.

[2] ma k, xiao j h, li x h, et al. sequence and expression analysis of the c3hc4-type ring finger gene family in rice[j]. gene,2009, (1-2): 33-45.

[3]李晓波,张俊武. 真核生物中锌指蛋白的结构与功能[j]. 中国生物化学与分子生物学报,2009,25(03):206-211.

4. 毕业设计（论文）计划

2018年11月-2018年12月，查阅相关文献，熟悉各种生物信息学数据库和软件；

2022年1月-2022年3月，完善技术路线，开展相关分析；

2022年4月-2022年5月，分析和整理实验结果，撰写论文。