玉米硫氧还蛋白基因家族的生物信息学分析任务书

 2022-11-15 10:05:04

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1. 掌握植物基因家族成员的鉴定、染色体分布和复制事件分析、系统发育、保守序列和基因表达分析等方法。

2. 鉴定出玉米基因组中的Trx基因,明确其进化历史与机制、基因表达模式、蛋白质互作情况等。

2. 实验内容和要求

1.玉米中trx基因的系统鉴定。通过关键词搜索、blast比对等手段鉴定出玉米中trx家族所有成员;

2. 基因复制和系统发育分析。通过分析trx基因的复制事件和系统发育关系,明确该家族的进化历史与机制;

3. 基因表达分析。通过检索ncbi est数据库获得基因表达信息,明确玉米trx基因在不同组织器官中的表达情况。

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3. 参考文献

[1] vieira ds c, laugier e, tarrago l, et al. specificity of thioredoxins and glutaredoxins as electron donors to two distinct classes of arabidopsis plastidial methionine sulfoxide reductases b[j]. febs lett.,2007, 581(23): 4371-4376.

[2] nuruzzaman m, gupta m, zhang c, et al. sequence and expression analysis of the thioredoxin protein gene family in rice[j]. mol.genet.genom.,2008, 280(2): 139-151.

[3] 潘增祥, 许丹, 张金璧, 等. 基于直向同源序列的比较基因组学研究[j]. 遗传, 2009, 31(5): 457-463.

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4. 毕业设计(论文)计划

2022年11月-2022年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件;

2022年1月-2022年3月,完善技术路线,开展各种分析;

2022年4月-2022年5月,分析和整理实验结果,撰写论文。

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