玉米DUF936基因家族的生物信息学分析任务书

 2022-11-15 10:05:16

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1. 掌握植物基因家族成员的鉴定、染色体分布和复制事件、系统发育和保守序列分析、基因表达分析等方法。

2. 鉴定出玉米基因组中的DUF936基因,明确其进化历史与机制、基因表达模式、蛋白质互作情况等。

2. 实验内容和要求

1. 玉米中duf936基因家族的成员鉴定。通过关键词搜索、blast比对等手段鉴定出玉米中duf936家族所有成员

2. 基因复制和系统发育分析。通过分析duf936基因的复制事件和系统发育关系,明确该家族的进化历史与机制;

3. 基因表达分析。通过检索ncbi est数据库获得基因表达信息,明确玉米duf936基因在不同组织器官中的表达情况。

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3. 参考文献

[1] li l h, ye t z, guan y, et al. genome-wide identification and analyses of the rice osduf936 family[j]. biotech. biotechnol. equip.,2018, 32(2): 309-315.

[2] bateman a,coggill p,finn rd.dufs:families in search of function[j]. acta crystallogr. sect. f,2010, 66(10): 1148–1152.

[3]tamurak,dudley j,nei m, et al. mega4:molecular evolutionary genetics analysis(mega) software version 4.0[j].mol.biol. evol.,2007,24(8):1596-1599.

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4. 毕业设计(论文)计划

2018年11月-2022年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件;

2022年1月-2022年3月,完善技术路线,开展相关分析;

2022年4月-2022年5月,分析和整理实验结果,撰写论文。

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