水稻AP2/ERF家族在植物逆境中的信息学研究任务书

1. 毕业设计（论文）的内容和要求

通过植物基因组测序，对逆境生长的水稻中的AP2/ERF家族基因于正常生长的水稻全基因组中进行功能性分析，最后对水稻的抗逆性能力的提升提供建议。

2. 实验内容和要求

（1）通过水稻基因组数据库获取正常生长的水稻的全基因序列信息。

（2）通过pfam和meme以及其他软件去筛选出正常生长的水稻的全部基因组中的ap2/erf家族基因。

（3）再利用expasy数据库对处于逆境中生长的水稻的ap2/erf家族蛋白进行分析，以获取等电点，溶解度，酸碱性，分子量等等基本信息。

3. 参考文献

[1]孙滨,占小登,曹立勇, 等.水稻ap2/erf转录因子的研究进展[j].农业生物技术学报,2017,25(11):1860-1869. doi:10.3969/j.issn.1674-7968.2017.11.013.

[2]贾树芹.用real-time方法筛选及验证水稻ap2/erebp转录因子家族中可能抗虫的基因[d].山东:曲阜师范大学,2014.

[3]muhammad rashid.collinearity prediction of the ap2/erf gene function across wheat (triticum aestivum l.) and rice (oryza sativa l.) genomes[d].湖北:华中科技大学,2012.

4. 毕业设计（论文）计划

2022年1月至2022年2月：通过水稻基因组数据库获取正常生长的水稻的全基因序列信息。

2022年2月至2022年3月：通过pfam和meme以及其他软件去筛选出正常生长的水稻的全部基因组中的ap2/erf家族基因。

2022年3月：选题，开题，搜集并研读相关文献。