基于网络药理学的菊花抗炎机制研究任务书

 2022-12-30 09:46:48

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

研究通过网络药理学方法,对菊花抗炎机制进行了系统分析,以探讨菊花治疗炎症的潜在作用机制,并得出了菊花可能参与治疗炎症作用的靶点与相关通路。

2. 实验内容和要求

通过Tcmsp数据库查询出菊花中的有效化合物成分,然后通过Uniprot数据库、Pubchem数据库和SEA数据库查出每个化合物对应的靶点,然后在Genecards数据库中检索出与抗炎作用相关的靶点,通过对比,得出化合物与抗炎作用的重复靶点。然后通过String数据库和相关软件,绘制出化合物和靶点的关系网络图。最后在DAVID数据库里对重复靶点进行GO和KEGG的富集分析,得出相关反应过程和信号通路。

菊花的化合物成分共有20个,总共有基因靶点314个,抗炎作用靶点共有3373个,重复靶点总共有175个。GO富集分析选取了20个项目,其中生物过程包括单器官代谢过程、脂质代谢过程、小分子代谢过程、对化学物质的反应、类固醇代谢过程等。细胞组成包括细胞外围、细胞表面、质膜、质膜部分、膜筏等。靶点涉及的分子功能包括氧化还原酶活性、催化活性、单加氧酶活性、血红素结合等。KEGG富集分析选取了20条信号通路,其中包括亚油酸代谢信号通路、类固醇激素生物合成信号通路、花生四烯酸代谢信号通路、VEGF信号通路等。

3. 参考文献

[1] 张金杰,吕文文,翁远超,等.野菊花中黄酮类成分的抗菌活性及指纹图谱[j].国际药学研究志,2013,40(6):807-812.

[2] 张金杰,陈宇峰,颜鸣,等.野菊花中的黄酮类化学成分[j].医药导报,2013,32(1):15-18.

[3] 吕文文,张金杰,丁召兴,等.hplc法测定不同产地野菊花黄酮苷的含量[j].滨州医学院学报,2016,39(2):120-123.

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4. 毕业设计(论文)计划

首先通过tcmsp数据库查询出菊花中的有效化合物成分,然后通过uniprot数据库、pubchem数据库和sea数据库查出每个化合物对应的靶点,然后在genecards数据库中检索出与抗炎作用相关的靶点,通过对比,得出化合物与抗炎作用的重复靶点。

然后通过string数据库和相关软件,绘制出化合物和靶点的关系网络图。

最后在david数据库里对重复靶点进行go和kegg的富集分析,得出相关反应过程和信号通路。

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