玉米FWL基因家族的生物信息学分析任务书

 2023-03-02 11:34:48

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1.掌握植物基因家族成员鉴定、分子进化和表达分析方法。

2.鉴定出玉米基因组中的FWL基因,明确其进化历史与机制及在不同组织器官中的表达情况。

2. 实验内容和要求

1.玉米fwl基因的系统鉴定。通过在玉米基因组数据库中进行blast比对搜索,鉴定出玉米fwl家族所有成员;

2. 基因复制事件和系统发育分析。通过分析玉米fwl基因复制事件和系统发育关系,明确该家族的进化历史与机制;

3. 基因表达模式分析。通过rna-seq数据分析,明确玉米fwl基因在不同组织器官中的表达模式。

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3. 参考文献

1. Dahan Y, Rosenfeld R, Zadiranov V, Irihimovitch V (2010) A proposed conserved role for an avocado FW2,2-like gene as anegative regulator of fruit cell division. Planta 232: 663-676.

2. Cong B,Tanksley SD (2006) FW2.2 and cell cycle control in developing tomato fruit:a possible example of gene co-option in the evolution of a novel organ. Plant Mol Biol 62: 867-880.

4. 毕业设计(论文)计划

2022年11月-2022年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件;

2022年1月-2022年3月,完善技术路线,开展各种分析;

2022年4月-2022年5月,分析和整理实验结果,撰写论文。

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